RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ORC4O43929 436 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MBD4O95243 580 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 HKR1P10072 659 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MATN1P21941 496 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MPP1Q00013 466 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 FAAH2Q6GMR7 532 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ACSM6Q6P461 480 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD16Q6P6B7 361 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TFAP2BQ92481 460 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 HVCN1Q96D96 273 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 PIGSQ96S52 555 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 REEP2Q9BRK0 252 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MAST3O60307 1309 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 RHOBTB3O94955 611 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TTLL1O95922 423 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ALADP13716 330 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFB7P17568 137 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 CTGFP29279 349 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 AVPR1BP47901 424 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 PCP4P48539 62 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 CCR5P51681 352 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TAP1Q03518 808 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 PDCLQ13371 301 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 FOXE3Q13461 319 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 DCTN1Q14203 1278 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 FAM187BQ17R55 369 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 PCGF5Q86SE9 256 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TSPYL6Q8N831 410 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 GLMPQ8WWB7 406 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPB3Q92617 1050 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 COQ10AQ96MF6 247 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 CA12O43570 354 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 NPSP0C0P6 89 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2C18P33260 490 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 GRK5P34947 590 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TLE3Q04726 772 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 DEUP1Q05D60 604 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 EFEMP1Q12805 493 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 SPATS1Q496A3 300 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ATG16L1Q676U5 607 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 WDR93Q6P2C0 686 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF503Q96F45 646 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 M0QZQ0 153 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 QSOX1O00391 747 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 STX16O14662 325 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 CYP3A4P08684 503 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TNNT1P13805 278 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MAN1A1P33908 653 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 LIFRP42702 1097 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 HYIQ5T013 277 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD44Q8N8A2 993 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MLST8Q9BVC4 326 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 RAB21Q9UL25 225 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8.6□□□□□ -1.03
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