RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-241	ENST00000487169	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CALCA	P01258	141 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SSTR1	P30872	391 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	BTK	Q06187	659 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CDH17	Q12864	832 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	C16orf89	Q6UX73	402 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CCDC126	Q96EE4	140 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	WNT7A	O00755	349 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MSC	O60682	206 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	STX5	Q13190	355 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	NOG	Q13253	232 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CSHL1	Q14406	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	IL17A	Q16552	155 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	LZTR1	Q8N653	840 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ASTN1	O14525	1302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169		A0A0U1RQJ8	604 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	GJB1	P08034	283 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ZACN	Q401N2	412 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	EPHB6	O15197	1021 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TPST1	O60507	370 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PLA2G6	O60733	806 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CABYR	O75952	493 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PJA2	O43164	708 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	FGR	P09769	529 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CPA3	P15088	417 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	OCA2	Q04671	838 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ACAP1	Q15027	740 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TMEM139	Q8IV31	216 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	RNF103	O00237	685 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	KDM1A	O60341	852 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	USP12	O75317	370 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MED21	Q13503	144 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	SHC3	Q92529	594 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	FANCG	O15287	622 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	KRT16	P08779	473 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	KCNA4	P22459	653 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	NOS2	P35228	1153 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	COPA	P53621	1224 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	OOSP2	Q86WS3	158 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-241	ENST00000487169	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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