RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PIGK	Q92643	395 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A1W2PPC1	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	NDUFB8	O95169	186 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	HOXB2	P14652	356 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PEX2	P28328	305 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	DUSP1	P28562	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	HOXD12	P35452	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF84	P51523	738 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM193A	P78312	1265 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	GBX1	Q14549	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	GRM3	Q14832	879 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	GJA10	Q969M2	543 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC28A2	O43868	658 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	DGKQ	P52824	942 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	CNGA3	Q16281	694 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	COG5	Q9UP83	839 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016		F8W810	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	SPTLC2	O15270	562 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	KCNQ3	O43525	872 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	USP12	O75317	370 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	IL18RAP	O95256	599 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	TFEB	P19484	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	NDUFS1	P28331	727 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ATIC	P31939	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ARRB2	P32121	409 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	MTA1	Q13330	715 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	MGEA5	O60502	916 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	RHCE	P18577	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	POLD2	P49005	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	RHD	Q02161	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	EVPL	Q92817	2033 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCFC2-209	ENST00000486016	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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