RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485692.1

GTF3C5-209, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-209ENST00000485692 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 TTI2Q6NXR4 508 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 TMEM270Q6UE05 265 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 FAM217AQ8IXS0 508 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 SCML4Q8N228 414 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 UBA3Q8TBC4 463 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 UCMAQ8WVF2 138 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF132P52740 706 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 STARD3Q14849 445 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 STILQ15468 1287 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 PKDCCQ504Y2 493 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 DDI1Q8WTU0 396 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 NELFBQ8WX92 580 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 RAD54BQ9Y620 910 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ACACBO00763 2458 aa21.89■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 TPRP12270 2363 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 E7ENQ6 273 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 BMP6P22004 513 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 GEN1Q17RS7 908 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 CEP76Q8TAP6 659 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 EDEM1Q92611 657 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.88■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 WASH3PC4AMC7 463 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 GNA14O95837 355 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ITPKAP23677 461 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF445P59923 1031 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 MORC3Q14149 939 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 CNGA2Q16280 664 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 LMO3Q8TAP4 145 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 TFAP2BQ92481 460 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ERLEC1Q96DZ1 483 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.87■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 M0QYV0 167 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 LATS1O95835 1130 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 LCP1P13796 627 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 PMLP29590 882 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 DAOAP59103 153 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 GCNT1Q02742 428 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF33AQ06730 810 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ENPP2Q13822 863 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 MPPE1Q53F39 396 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 IRGQQ8WZA9 623 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.86■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 CEP192Q8TEP8 1941 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 TIMM44O43615 452 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 CFIP05156 583 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 ENGP17813 658 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 PAK1Q13153 545 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 FUT11Q495W5 492 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 PMF1Q6P1K2 205 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 DEFB119Q8N690 84 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 GOLGA1Q92805 767 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 KAT5Q92993 513 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 EPG5Q9HCE0 2579 aa21.85■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 BIN1O00499 593 aa21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
GTF3C5-209ENST00000485692 NDUFS2O75306 463 aa21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms