RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD40Q6AI12 368 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 SDE2Q6IQ49 451 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 SLC23A3Q6PIS1 610 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 BHLHA9Q7RTU4 235 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 GAS2L3Q86XJ1 694 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 DENND1CQ8IV53 801 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 MRGPRX1Q96LB2 322 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 HSPA12BQ96MM6 686 aa13.24□□□□□ -0.29
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PRAME-212ENST00000485532 TSPY26PQ9H489 355 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 CLIC5Q9NZA1 410 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 WASF3Q9UPY6 502 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 STON1Q9Y6Q2 735 aa13.24□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 CACNA1EQ15878 2313 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 ASPMQ8IZT6 3477 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 SLC12A8A0AV02 714 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 TRIM49BA6NDI0 452 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 CETN3O15182 167 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 PENKP01210 267 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 C1QTNF9P0C862 333 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 MAOBP27338 520 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 TKTL1P51854 596 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 MFAP3P55082 362 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 PDE4CQ08493 712 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 LMAN2Q12907 356 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 LRMPQ12912 555 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 ANO6Q4KMQ2 910 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 SPDYCQ5MJ68 293 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP17Q68EM7 881 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 SLC36A4Q6YBV0 504 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 ZNF276Q8N554 614 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 UBA3Q8TBC4 463 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 SORCS1Q8WY21 1168 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 ULBP1Q9BZM6 244 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 MARCH2Q9P0N8 246 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 ZZEF1O43149 2961 aa13.23□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 SPEGQ15772 3267 aa13.23□□□□□ -0.29
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PRAME-212ENST00000485532 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa13.22□□□□□ -0.29
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PRAME-212ENST00000485532 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 IL12RB1P42701 662 aa13.22□□□□□ -0.29
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PRAME-212ENST00000485532 DUOXA1Q1HG43 343 aa13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 FUT11Q495W5 492 aa13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 COBLL1Q53SF7 1204 aa13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 TMEM215Q68D42 235 aa13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 TADA2BQ86TJ2 420 aa13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 CACUL1Q86Y37 369 aa13.22□□□□□ -0.29
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PRAME-212ENST00000485532 EDEM1Q92611 657 aa13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 CAPN10Q9HC96 672 aa13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 TSPAN16Q9UKR8 245 aa13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 SLC6A14Q9UN76 642 aa13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa13.22□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 KCNJ18B7U540 433 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 PIK3R2O00459 728 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 STX10O60499 249 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 ZNF217O75362 1048 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 ZBED1O96006 694 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 SERPINF2P08697 491 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 CD19P15391 556 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 PRKCHP24723 683 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 CHKAP35790 457 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 FAM193AP78312 1265 aa13.21□□□□□ -0.29
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PRAME-212ENST00000485532 ADIGQ0VDE8 80 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 ZNF234Q14588 700 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 PM20D1Q6GTS8 502 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 FMNL3Q8IVF7 1028 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 RGL4Q8IZJ4 473 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 MINDY1Q8N5J2 469 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 UBXN6Q9BZV1 441 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 DCLK3Q9C098 648 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 DNAI2Q9GZS0 605 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 STRIP2Q9ULQ0 834 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 ZNF510Q9Y2H8 683 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 COQ4Q9Y3A0 265 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 CKAP5Q14008 2032 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-212ENST00000485532 CHD6Q8TD26 2715 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 YJEFN3A6XGL0 299 aa13.2□□□□□ -0.3
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