RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 TLR2O60603 784 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 PLAUP00749 431 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 MYL3P08590 195 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 CTSAP10619 480 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 GSTM5P46439 218 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 CASP5P51878 434 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 SEMA3BQ13214 749 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 MTA1Q13330 715 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNJ12Q14500 433 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 FCRL5Q96RD9 977 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHAC1Q9H158 963 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A1W2PPC4 97 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 RRHO14718 337 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF3BO15066 747 aa4.87□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 VIPP01282 170 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 ITGB6P18564 788 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 MATN1P21941 496 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 MMP8P22894 467 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 DUSP1P28562 367 aa4.87□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 ME1P48163 572 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 FHL1Q13642 323 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 FHL3Q13643 280 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 ARL13BQ3SXY8 428 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 DEF8Q6ZN54 512 aa4.87□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 C8orf48Q96LL4 319 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR24Q96S15 920 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 TM2D2Q9BX73 214 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.634e-6■■□□□ 14
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RABGGTB-210ENST00000485459 CEP83Q9Y592 693 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 PROB1E7EW31 1015 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 H3BNX3 289 aa4.86□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 MAPK7Q13164 816 aa4.86□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
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RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM27P14373 513 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 ST6GAL1P15907 406 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 NDUFS1P28331 727 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC8A1P32418 973 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 THBS4P35443 961 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 PMS2P11Q13670 270 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP1A4Q13733 1029 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.85□□□□□ -1.63
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