RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484396.1

ACSS1-204, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACSS1, Length 4,767 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-204ENST00000484396 CHST13Q8NET6 341 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ANKRD49Q8WVL7 239 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PYDC1Q8WXC3 89 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TOR4AQ9NXH8 423 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 DNAJB4Q9UDY4 337 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ATP8B3O60423 1300 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PRCPP42785 496 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 STAT5BP51692 787 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 VBP1P61758 197 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 KRT17Q04695 432 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TOMM20Q15388 145 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 FAM45BPQ6NSW5 357 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RHPN2Q8IUC4 686 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 BRD7Q9NPI1 651 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SPO11Q9Y5K1 396 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RARBP10826 455 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CASP1P29466 404 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 C6orf89Q6UWU4 347 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 IKBIPQ70UQ0 350 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TMC3Q7Z5M5 1100 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PALB2Q86YC2 1186 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PSKH2Q96QS6 385 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TOR3AQ9H497 397 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ELOVL6Q9H5J4 265 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 LRRC4Q9HBW1 653 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PFASO15067 1338 aa13.1□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ZNF862O60290 1169 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SMUG1Q53HV7 270 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 KLHL35Q6PF15 583 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 KLHDC10Q6PID8 442 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 KLHL17Q6TDP4 642 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CENPSQ8N2Z9 138 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 OR7A2PQ8NGA2 310 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CNDP1Q96KN2 507 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 AP4B1Q9Y6B7 739 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 A0A1W2PQJ5 194 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TTI2Q6NXR4 508 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PSMA8Q8TAA3 256 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 KATNAL1Q9BW62 490 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 OSBPL11Q9BXB4 747 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 COX16Q9P0S2 106 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PFDN2Q9UHV9 154 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 AGPSO00116 658 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 GH1P01241 217 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 THRAP10827 490 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ECT2LQ008S8 904 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ZNF568Q3ZCX4 644 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 GPR107Q5VW38 600 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ARMCX2Q7L311 632 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TREML1Q86YW5 311 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 POU5F2Q8N7G0 328 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 URGCPQ8TCY9 931 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PHF20Q9BVI0 1012 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 VPS51Q9UID3 782 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PEX1O43933 1283 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PRKD3O94806 890 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 DSTNP60981 165 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ERVK-24P63145 666 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RAD51Q06609 339 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SYTL1Q8IYJ3 562 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 C19orf18Q8NEA5 215 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 OR2B2Q9GZK3 357 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 IL25Q9H293 177 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 FANCFQ9NPI8 374 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TAS2R1Q9NYW7 299 aa13.09□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CCDC78A2IDD5 438 aa13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 YES1P07947 543 aa13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 FCGR1AP12314 374 aa13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SQLEQ14534 574 aa13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PRPSAP1Q14558 356 aa13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SCFD2Q8WU76 684 aa13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 AK9Q5TCS8 1911 aa13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms