RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 DUPD1Q68J44 220 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 HDXQ7Z353 690 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 METTL23Q86XA0 190 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 DEFB106AQ8N104 65 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 URGCPQ8TCY9 931 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF333Q96JL9 665 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 UROC1Q96N76 676 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 TBCBQ99426 244 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 PKMYT1Q99640 499 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 CDH9Q9ULB4 789 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 PTPRSQ13332 1948 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 PRPSAP2O60256 369 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 RNF8O76064 485 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 AMHP03971 560 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 FYNP06241 537 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 TUBBP07437 444 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 USP17L7P0C7H9 530 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 COL6A1P12109 1028 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 ETS1P14921 441 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 MCM3P25205 808 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 ITGB8P26012 769 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 PCSK1P29120 753 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 SDC4P31431 198 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 ACADSBP45954 432 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 MAP2K3P46734 347 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 GPR15P49685 360 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 VPS41P49754 854 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 PGFP49763 221 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 ARSEP51690 589 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 HDAC4P56524 1084 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 KRT17Q04695 432 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 FAM171BQ6P995 826 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 NPNTQ6UXI9 565 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 CEP57Q86XR8 500 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 RFX6Q8HWS3 928 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC185Q8N715 623 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 KCTD6Q8NC69 237 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 RUBCNQ92622 972 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 HSFY1Q96LI6 401 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC114Q96M63 670 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 ERP44Q9BS26 406 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 CALN1Q9BXU9 219 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.38□□□□□ -1.39
SKAP2-204ENST00000481204 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms