RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ATG13O75143 517 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 APODP05090 189 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 FMO1Q01740 532 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A3Q01959 620 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 RING1Q06587 406 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NR1I3Q14994 352 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 NFKBIBQ15653 356 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 TAC4Q86UU9 113 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 DEFB106AQ8N104 65 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 ADAM32Q8TC27 787 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 USP33Q8TEY7 942 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 SERPINB11Q96P15 392 aa21.83■■□□□ 1.09
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ACTB-211ENST00000480301 SYNCQ9H7C4 482 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 PLK2Q9NYY3 685 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 DEC1Q9P2X7 70 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 FBXO10Q9UK96 956 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-211ENST00000480301 ATG2BQ96BY7 2078 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 K7ESF4 209 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 GFRA2O00451 464 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 LATS1O95835 1130 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 IGLV3-25P01717 112 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 CISD3P0C7P0 127 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 HOXC13P31276 330 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 NOMO3P69849 1222 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 NNTQ13423 1086 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 ERICH1Q86X53 443 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 BHMTQ93088 406 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 SLC39A13Q96H72 371 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 R4GN57 208 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 FAM170AA1A519 330 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 PROB1E7EW31 1015 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 HSF2BPO75031 334 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 GRAP2O75791 330 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 SERPINC1P01008 464 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF4P43489 277 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 SEC13P55735 322 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 TPM4P67936 248 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 FANCCQ00597 558 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R5DQ14738 602 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 DCAF6Q58WW2 860 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 ADGRF1Q5T601 910 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 NAA35Q5VZE5 725 aa21.81■■□□□ 1.08
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ACTB-211ENST00000480301 GRAMD4Q6IC98 578 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 CCDC26Q8TAB7 109 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 BAP1Q92560 729 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 AZIN2Q96A70 460 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 C18orf8Q96DM3 657 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D3BA6NDS4 549 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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ACTB-211ENST00000480301 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 C2orf27AQ580R0 203 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 EMC10Q5UCC4 262 aa21.8■■□□□ 1.08
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ACTB-211ENST00000480301 TERB1Q8NA31 727 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.8■■□□□ 1.08
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ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.79■■□□□ 1.08
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ACTB-211ENST00000480301 ACSL4O60488 711 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN3O60637 253 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 DAB1O75553 588 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 CYBBP04839 570 aa21.79■■□□□ 1.08
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ACTB-211ENST00000480301 C2CD6Q53TS8 623 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 SYT13Q7L8C5 426 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 HCN2Q9UL51 889 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 MYO6Q9UM54 1294 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 LILRB5O75023 590 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 HOXA6P31267 233 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A4P31645 630 aa21.78■■□□□ 1.08
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