RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 ATP2C2O75185 946 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 TBCAO75347 108 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 PPP1R37O75864 691 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 ITGB3P05106 788 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 DCTP40126 519 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 CD97P48960 835 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 USP46P62068 366 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 IL9RQ01113 521 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 KDSRQ06136 332 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 MORC3Q14149 939 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF787Q6DD87 383 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 ADALQ6DHV7 355 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 C12orf40Q86WS4 652 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 SLC34A3Q8N130 599 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 THEM5Q8N1Q8 247 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 OXR1Q8N573 874 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 TERB1Q8NA31 727 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 SAP25Q8TEE9 199 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 SCFD1Q8WVM8 642 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 RAD54LQ92698 747 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 OTUB2Q96DC9 234 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 PARVGQ9HBI0 331 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 KCND2Q9NZV8 630 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 GCNT4Q9P109 453 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 SIX4Q9UIU6 781 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 DERAQ9Y315 318 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 C2CD2Q9Y426 696 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.32□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 GOLGA8JA6NMD2 632 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 KPNA7A9QM74 516 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 CBX4O00257 560 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 NPC1O15118 1278 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 VILLO15195 856 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 IGLV3-19P01714 112 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 KRT18P05783 430 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 CD27P26842 260 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 TPMTP51580 245 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 CACNA2D1P54289 1103 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 GTF2BQ00403 316 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 CLN3Q13286 438 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 SV2CQ496J9 727 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 METTL23Q86XA0 190 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 SPOCK2Q92563 424 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 MYLPFQ96A32 169 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 MYRFLQ96LU7 910 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 FAM213AQ9BRX8 229 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 ABCG4Q9H172 646 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 CD248Q9HCU0 757 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 WDR70Q9NW82 654 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 DSEQ9UL01 958 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 FLNCQ14315 2725 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.31□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.3□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 LRRK2Q5S007 2527 aa8.3□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 SMTNL1A8MU46 457 aa8.3□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 H0YCG3 227 aa8.3□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 LEFTY2O00292 366 aa8.3□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 CYP26A1O43174 497 aa8.3□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 EFSO43281 561 aa8.3□□□□□ -1.08
SZRD1-208ENST00000476423 VPS4BO75351 444 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms