RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ELF2	Q15723	593 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	TAF12	Q16514	161 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	FAM131B	Q86XD5	332 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ELMOD1	Q8N336	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	LEMD2	Q8NC56	503 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	EDEM1	Q92611	657 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	AZIN2	Q96A70	460 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	SLC39A13	Q96H72	371 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	EPAS1	Q99814	870 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	GDF15	Q99988	308 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RPS18-231	ENST00000472218	PATJ	Q8NI35	1801 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	APOL1	O14791	398 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	TGM5	O43548	720 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PAPLN	O95428	1278 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ECEL1	O95672	775 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	IGLV3-27	P01718	113 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ITGAV	P06756	1048 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DNAJB2	P25686	324 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	KLRC2	P26717	231 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	RABGGTB	P53611	331 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	HECTD3	Q5T447	861 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	AADACL2	Q6P093	401 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	RFX6	Q8HWS3	928 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC185	Q8N715	623 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ANKRD7	Q92527	254 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	HAUS1	Q96CS2	278 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	GDF3	Q9NR23	364 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	MSRA	Q9UJ68	235 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	NR2E1	Q9Y466	385 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	NCAM2	O15394	837 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	RAD51C	O43502	376 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	LIAS	O43766	372 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	TLR5	O60602	858 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	APOE	P02649	317 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	LRG1	P02750	347 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	CA3	P07451	260 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	KRT10	P13645	584 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	HOXC13	P31276	330 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	TBX4	P57082	545 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ERVFC1	P60507	584 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	COG7	P83436	770 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF33A	Q06730	810 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	TWF1	Q12792	350 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	DPYS	Q14117	519 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS18-231	ENST00000472218	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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