RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466247.1

RBM6-215, Transcript of RNA binding motif protein 6, human

TSL 2

Gene RBM6, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM6-215	ENST00000466247	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	FZD4	Q9ULV1	537 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247		J3KTA2	159 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	PLA2G6	O60733	806 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	VIP	P01282	170 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	ALAD	P13716	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	PPM1A	P35813	382 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	PLCD1	P51178	756 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247		Q4G0T1	1027 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	GGT6	Q6P531	493 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	MUL1	Q969V5	352 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	BMP15	O95972	392 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	DGKQ	P52824	942 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	STARD3	Q14849	445 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	RABEP1	Q15276	862 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247		M0QZQ0	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	PCDH17	O14917	1159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	TEC	P42680	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	GSTM5	P46439	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	JAK3	P52333	1124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM6-215	ENST00000466247	ERCC6	Q03468	1493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ADAM10	O14672	748 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	DHH	O43323	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TAF5L	O75529	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	FGB	P02675	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TACR3	P29371	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	BTK	Q06187	659 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	GAB1	Q13480	694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	GRM4	Q14833	912 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ELF2	Q15723	593 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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