RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	WDR24	Q96S15	920 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454		J3KTA2	159 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PCDH17	O14917	1159 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	DNPH1	O43598	174 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CERS1	P27544	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MCM5	P33992	734 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ARL4C	P56559	192 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	C21orf58	P58505	322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CFHR3	Q02985	330 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	POSTN	Q15063	836 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	RUBCN	Q92622	972 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454		H3BNC9	293 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	IRAK2	O43187	625 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ACTL6B	O94805	426 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	YY1	P25490	414 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	AP2B1	P63010	937 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TFF2	Q03403	129 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CSHL1	Q14406	222 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	RITA1	Q96K30	269 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TISP43	B9A030	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	RNF8	O76064	485 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	GYS1	P13807	737 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MMP8	P22894	467 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	FOXF2	Q12947	444 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MTAP	Q13126	283 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	KCNB1	Q14721	858 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	GRM4	Q14833	912 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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