RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464001.1

ITGB1-208, Transcript of integrin subunit beta 1, human

TSL 2

Gene ITGB1, Length 316 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGB1-208	ENST00000464001	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	PAX3	P23760	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	HTR6	P50406	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	BIRC2	Q13490	618 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	GBX1	Q14549	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	PRC1	O43663	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	DUSP1	P28562	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MTA1	Q13330	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	GRM3	Q14832	879 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001		F8W810	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	THAP12	O43422	761 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TSPAN6	O43657	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TFEB	P19484	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ATIC	P31939	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	PBX1	P40424	430 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	VPS41	P49754	854 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	FHL3	Q13643	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001		F8W8V4	182 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	SH3BP5	O60239	455 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	COQ9	O75208	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	RHCE	P18577	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	MATN1	P21941	496 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	RHD	Q02161	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	NME8	Q8N427	588 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	PHKB	Q93100	1093 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGB1-208	ENST00000464001	AREL1	O15033	823 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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