RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 DCLK3Q9C098 648 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF38Q9H0F5 515 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 PIGVQ9NUD9 493 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CDH7Q9ULB5 785 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 USP18Q9UMW8 372 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC66A2RUB6 948 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ESPNB1AK53 854 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 MSI1O43347 362 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 FTCDO95954 541 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV3-27P01718 113 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNA5P22460 613 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CTNNA2P26232 953 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS6KA1Q15418 735 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CLUL1Q15846 466 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ODF2Q5BJF6 829 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 EFHC2Q5JST6 749 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ERMARDQ5T6L9 678 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM131BQ86XD5 332 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC35F6Q8N357 371 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 TEKT4Q8WW24 435 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ING5Q8WYH8 240 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 SUSD6Q92537 303 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 FGF13Q92913 245 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 AZIN2Q96A70 460 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 NTAN1Q96AB6 310 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC39A13Q96H72 371 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 BTN2A3PQ96KV6 586 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 HAPLN3Q96S86 360 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 TDP1Q9NUW8 608 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 PCSK1NQ9UHG2 260 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM50BQ9Y247 325 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF510Q9Y2H8 683 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CPQQ9Y646 472 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CTAGE9A4FU28 777 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNU1A8MYU2 1149 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 STC2O76061 302 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 LATS1O95835 1130 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 HMBSP08397 361 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 TNNT1P13805 278 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 TCF3P15923 654 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CASQ1P31415 396 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ADRA1BP35368 520 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CETN2P41208 172 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC11A2P49281 568 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 RWDD2BP57060 319 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 TAS2R40P59535 323 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 SCAPQ12770 1279 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP7D3Q8IWC1 876 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 SMARCD2Q92925 531 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 CD101Q93033 1021 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 E2F7Q96AV8 911 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 HES6Q96HZ4 224 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC22A12Q96S37 553 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP4-208ENST00000462602 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms