RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 GLMPQ8WWB7 406 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 C3orf49Q96BT1 292 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 UROC1Q96N76 676 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SNX18Q96RF0 628 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CYR61O00622 381 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 NKX2-8O15522 239 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SUV39H1O43463 412 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CA12O43570 354 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 JTBO76095 146 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SERPINA4P29622 427 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ACVRL1P37023 503 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 POU5F1BQ06416 359 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 DPTQ07507 201 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.397e-18■■□□□ 13.7
RABGGTB-205ENST00000462042 TAF5Q15542 800 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TAF12Q16514 161 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM187BQ17R55 369 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TERB1Q8NA31 727 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CIPCQ9C0C6 399 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 USP29Q9HBJ7 922 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 VPS45Q9NRW7 570 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TLK1Q9UKI8 766 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 BAG5Q9UL15 447 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 TTC34A8MYJ7 566 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF28PB7ZC32 967 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 H7C1Q1 480 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 TK1P04183 234 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 THBS4P35443 961 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 JAK3P52333 1124 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 ACTR2P61160 394 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 GPC5P78333 572 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 FHL2Q14192 279 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 AAK1Q2M2I8 961 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 FZD4Q9ULV1 537 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 BTBD19C9JJ37 291 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 MT-CO3P00414 261 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 C1RP00736 705 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 FPR3P25089 353 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 PLA2G5P39877 138 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 TLE3Q04726 772 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 ALFQ53S48 1182 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 WDR93Q6P2C0 686 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 GGNQ86UU5 652 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 TBATAQ96M53 351 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 MMS19Q96T76 1030 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 RASSF1Q9NS23 344 aa6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 E7EVH7 732 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BNC9 293 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 EXOC3O60645 756 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE8BO95263 885 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP3A4P08684 503 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 ALADP13716 330 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 GPD1P21695 349 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 ITPKBP27987 946 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 MAPK9P45984 424 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP4F2P78329 520 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 CUL4BQ13620 913 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.31□□□□□ -1.4
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