RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 RLN3Q8WXF3 142 aa25.08■■□□□ 1.61
PPP1CB-208ENST00000455580 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC30A4O14863 429 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 FBXO21O94952 628 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 CYBBP04839 570 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MSANTD2Q6P1R3 559 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 GBP6Q6ZN66 633 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 CHPFQ8IZ52 775 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 PGBD3Q8N328 593 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM81BQ96LP2 452 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 GABRG3Q99928 467 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 VPS45Q9NRW7 570 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 STOML2Q9UJZ1 356 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 GFRA2O00451 464 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 LTFP02788 710 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 GABRG2P18507 467 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 CREB5Q02930 508 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MAP7D1Q3KQU3 841 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 GJB7Q6PEY0 223 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 DDI1Q8WTU0 396 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF606Q8WXB4 792 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SMOC1Q9H4F8 434 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 CD248Q9HCU0 757 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 CLEC4EQ9ULY5 219 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCA7Q8IZY2 2146 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 LATS1O95835 1130 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MEA1Q16626 185 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 GEN1Q17RS7 908 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MPPE1Q53F39 396 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 DENND1BQ6P3S1 775 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 FRMD1Q8N878 549 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 STK32AQ8WU08 396 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC2A11Q9BYW1 496 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MIS12Q9H081 205 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 THAP9Q9H5L6 903 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 DCDC2BA2VCK2 349 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MSI1O43347 362 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MED7O43513 233 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 CAVIN2O95810 425 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 APBA1Q02410 837 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ADGRF1Q5T601 910 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA1211LQ6NV74 962 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SCUBE3Q8IX30 993 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 GOLGA1Q92805 767 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SPACA7Q96KW9 195 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ST7Q9NRC1 585 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 RXFP3Q9NSD7 469 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 APEX2Q9UBZ4 518 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 CACNA1AO00555 2505 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 BECN2A8MW95 431 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 WASH3PC4AMC7 463 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 TSPAN3O60637 253 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 IGLV3-27P01718 113 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 FYNP06241 537 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 PON1P27169 355 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ACADSBP45954 432 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 LIMK1P53667 647 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF445P59923 1031 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC4A5Q9BY07 1137 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ACP6Q9NPH0 428 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 NPC1O15118 1278 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 MAP3K13O43283 966 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 GNA15P30679 374 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP44Q17R89 818 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 DPCR1Q3MIW9 517 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 LPCAT2Q7L5N7 544 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM110Q86TL2 294 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 UNC45BQ8IWX7 931 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SHC3Q92529 594 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 CYTH4Q9UIA0 394 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 RAD54BQ9Y620 910 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 STON1Q9Y6Q2 735 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP1CB-208ENST00000455580 SART1O43290 800 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PPP1CB-208ENST00000455580 THAP12O43422 761 aa25.01■■□□□ 1.59
PPP1CB-208ENST00000455580 NCAM1P13591 858 aa25.01■■□□□ 1.59
PPP1CB-208ENST00000455580 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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