RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 MSANTD2Q6P1R3 559 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 CHPFQ8IZ52 775 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 PGBD3Q8N328 593 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 CPXM2Q8N436 756 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 MDGA1Q8NFP4 955 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 HMGB4Q8WW32 186 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 VPS16Q9H269 839 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa28.92■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 CAPN9O14815 690 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 SART1O43290 800 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 MBD3O95983 291 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 PENKP01210 267 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 CISD3P0C7P0 127 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 GBP1P32455 592 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 TBX4P57082 545 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 PDCLQ13371 301 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 MEA1Q16626 185 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 ADAM32Q8TC27 787 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 SLC4A5Q9BY07 1137 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 PARD6AQ9NPB6 346 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 ANO10Q9NW15 660 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 FHOD1Q9Y613 1164 aa28.91■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 TPM2P07951 284 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 HOXB2P14652 356 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 NTSR1P30989 418 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 KRT9P35527 623 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 KCNMA1Q12791 1236 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 SDE2Q6IQ49 451 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 SLC47A2Q86VL8 602 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 KCNV2Q8TDN2 545 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 STK32AQ8WU08 396 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 ACOX2Q99424 681 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 TJP2Q9UDY2 1190 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 HCN2Q9UL51 889 aa28.9■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 ID4P47928 161 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 RPL34P49207 117 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 STX1AQ16623 288 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 MPPE1Q53F39 396 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC183Q5T5S1 534 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 PDCL3Q9H2J4 239 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 PLCB1Q9NQ66 1216 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 CLEC4EQ9ULY5 219 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 STARD13Q9Y3M8 1113 aa28.89■■■□□ 2.22
FAAP20-210ENST00000440825 FYNP06241 537 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 CLCN1P35523 988 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 KRT31Q15323 416 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC6Q16204 474 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 ADGRF1Q5T601 910 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 RASSF3Q86WH2 238 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 UNC45BQ8IWX7 931 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 FAM217AQ8IXS0 508 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 SERPINB11Q96P15 392 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 FANCLQ9NW38 375 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 FBXO10Q9UK96 956 aa28.88■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 FAM170AA1A519 330 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 SLC11A2P49281 568 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 ELF2Q15723 593 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 GEN1Q17RS7 908 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 PLK5Q496M5 336 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 SYPL2Q5VXT5 272 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 NUGGCQ68CJ6 796 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM110Q86TL2 294 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 RLN3Q8WXF3 142 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 NOX5Q96PH1 765 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 CPXM1Q96SM3 734 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 PCDHGC3Q9UN70 934 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 DMXL1Q9Y485 3027 aa28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 CDKAL1Q5VV42 579 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 RFWD3Q6PCD5 774 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 TAC4Q86UU9 113 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 FAM71AQ8IYT1 594 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 WDTC1Q8N5D0 677 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 TRIM62Q9BVG3 475 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 SYNCQ9H7C4 482 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 POPDC2Q9HBU9 364 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 SEMA4GQ9NTN9 838 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 CEP83Q9Y592 693 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 RAD54BQ9Y620 910 aa28.86■■■□□ 2.21
FAAP20-210ENST00000440825 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms