RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 FRYLO94915 3013 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 NRCAMQ92823 1304 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCN1AP35498 2009 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 C5orf60A6NFR6 353 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 LACTBL1A8MY62 500 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSPAN1O60635 241 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPAG6O75602 509 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 MICAL2O94851 1124 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 GNAT1P11488 350 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 KLRC2P26717 231 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDKN2BP42772 138 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 GABRB2P47870 512 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 VPS41P49754 854 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAD23BP54727 409 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARL4CP56559 192 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPS1Q13098 491 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT81Q14533 505 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDK2Q15119 407 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIF1AQ16665 826 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 BBS12Q6ZW61 710 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 UNC93AQ86WB7 457 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 RFX6Q8HWS3 928 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 HACE1Q8IYU2 909 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCTD6Q8NC69 237 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SGSM3Q96HU1 749 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNPY3Q9BT09 278 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM7Q9C029 511 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYLDQ9NQC7 956 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 FETUBQ9UGM5 382 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1B0GUA9 196 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF487B1APH4 448 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 M0QZ92 97 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 O00370 1275 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRCH4O75427 683 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 FGF18O76093 207 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPP00450 1065 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 VTNP04004 478 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SHBGP04278 402 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 TGM2P21980 687 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SDC4P31431 198 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCNN1AP37088 669 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAGEA4P43358 317 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACADSBP45954 432 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAP1GAPP47736 663 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCAT1P54687 386 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 ROR1Q01973 937 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC20A2Q08357 652 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 RASA2Q15283 850 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 AMHR2Q16671 573 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 SV2CQ496J9 727 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 C2CD6Q53TS8 623 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.55□□□□□ -1.36
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.55□□□□□ -1.36
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