RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEKT3Q9BXF9 490 aa4.93□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.93□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOCK8Q8NF50 2099 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO10Q9HD67 2058 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 DENND3A2RUS2 1198 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 H3BQ06 376 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 EDIL3O43854 480 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 HBP1O60381 514 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 PFKFB2O60825 505 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFS2O75306 463 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS6KA5O75582 802 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTDNEP1O95476 244 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP3A4P08684 503 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNA5P22460 613 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLRC1P26715 233 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT2P35908 639 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 PBX3P40426 434 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ETV4P43268 484 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC5A3P53794 718 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP4A11Q02928 519 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 DRP2Q13474 957 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 LONRF3Q496Y0 759 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPC2Q52LR7 807 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM228AQ86W67 206 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHPFQ8IZ52 775 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPM1NQ8N819 430 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC01356Q8N9X3 169 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 NLRP4Q96MN2 994 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP7D2Q96T17 732 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM168Q9H0V1 697 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 PADI3Q9ULW8 664 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 INSL6Q9Y581 213 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 MIA3Q5JRA6 1907 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYO15AQ9UKN7 3530 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 TBKBP1A7MCY6 615 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRM6O15303 877 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUAK1O60285 661 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFPL1O75677 317 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 PF4V1P10720 104 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 XBP1P17861 261 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 XPAP23025 273 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSF2RBP32927 897 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 CA8P35219 290 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC26A2P50443 739 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 JAK3P52333 1124 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 RRADP55042 308 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 EVCP57679 992 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD69Q07108 199 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 MGAT5Q09328 741 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPM6BQ13491 265 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCOLCEQ15113 449 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADRM1Q16186 407 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANO4Q32M45 955 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCEAL5Q5H9L2 206 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF484Q5JVG2 852 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM26FQ5R3K3 315 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFCAB12Q6NXP0 572 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEK8Q86SG6 692 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPH2Q8IWU9 490 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXL16Q8N461 479 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOP1MTQ969P6 601 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 MBD6Q96DN6 1003 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 AJUBAQ96IF1 538 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM167AQ96KS9 214 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR92Q96MX6 357 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASB2Q96Q27 587 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms