RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

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Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 CPQQ9Y646 472 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 F8VP50 259 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CLDN5O00501 218 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM24O15164 1050 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 GRIK1P39086 918 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CYP27A1Q02318 531 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 KDSRQ06136 332 aa6.97□□□□□ -1.29
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HOXD8-202ENST00000429017 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.97□□□□□ -1.29
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HOXD8-202ENST00000429017 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.97□□□□□ -1.29
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HOXD8-202ENST00000429017 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.97□□□□□ -1.29
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HOXD8-202ENST00000429017 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXD8-202ENST00000429017 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.97□□□□□ -1.29
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HOXD8-202ENST00000429017 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF233A6NK53 670 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 COCHO43405 550 aa6.95□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 ABL1P00519 1130 aa6.95□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 ADH5P11766 374 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ENGP17813 658 aa6.95□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 GABRG2P18507 467 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ITPKAP23677 461 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ANXA13P27216 316 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 STAT6P42226 847 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 MAPK8P45983 427 aa6.95□□□□□ -1.3
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HOXD8-202ENST00000429017 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf74Q86VG3 221 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 WDR49Q8IV35 697 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 PDILTQ8N807 584 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 NAT16Q8N8M0 369 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 HMGB4Q8WW32 186 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-202ENST00000429017 P2RY11Q96G91 374 aa6.95□□□□□ -1.3
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