RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425868.5

BBX-208, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 4

Gene BBX, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-208ENST00000425868 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 TMPRSS11DO60235 418 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 LPXNO60711 386 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 CAPN3P20807 821 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 E2F1Q01094 437 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 GPR68Q15743 365 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 NRN1LQ496H8 165 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 CCDC30Q5VVM6 783 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 LNX2Q8N448 690 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 C8orf49Q96NF6 230 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PRR25Q96S07 402 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ACAD9Q9H845 621 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 DKK3Q9UBP4 350 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 DKK2Q9UBU2 259 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 AASSQ9UDR5 926 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 VPS4AQ9UN37 437 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.26□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PEX12O00623 359 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 NKX2-8O15522 239 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PROM1O43490 865 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 SPRY2O43597 315 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 NR2F6P10588 404 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 NR4A1P22736 598 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 CXCR5P32302 372 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PTGS2P35354 604 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 RCAN1P53805 252 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 CASP6P55212 293 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 LRRC24Q50LG9 513 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 NME8Q8N427 588 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 LINS1Q8NG48 757 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 NPIPB3Q92617 1050 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PBKQ96KB5 322 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 C20orf173Q96LM9 149 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 USP29Q9HBJ7 922 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 AMFRQ9UKV5 643 aa6.25□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 CYP21A2P08686 494 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 WEE2P0C1S8 567 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PEPDP12955 493 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 NDUFB7P17568 137 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 MCM5P33992 734 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PAFAH1B1P43034 410 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 CYP1B1Q16678 543 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ANO7Q6IWH7 933 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 WDR93Q6P2C0 686 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ASB10Q8WXI3 467 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 RNF125Q96EQ8 232 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 Q96MF0 132 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 HSF4Q9ULV5 492 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 FZD1Q9UP38 647 aa6.24□□□□□ -1.41
BBX-208ENST00000425868 GDAQ9Y2T3 454 aa6.24□□□□□ -1.41
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