RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGLV3-27P01718 113 aa18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OPRD1P41143 372 aa18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDK17Q00537 523 aa18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO43Q4G163 708 aa18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FSTL4Q6MZW2 842 aa18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XYLT1Q86Y38 959 aa18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEFB106AQ8N104 65 aa18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAM32Q8TC27 787 aa18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM204AQ9H8W3 233 aa18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MARK1Q9P0L2 795 aa18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TLR6Q9Y2C9 796 aa18.09■□□□□ 0.49
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1W2PQJ5 194 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IRAK2O43187 625 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EGFP01133 1207 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYBBP04839 570 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UNGP13051 313 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TYRP14679 529 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MMP8P22894 467 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC11A2P49281 568 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CENPCQ03188 943 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C12orf40Q86WS4 652 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1orf210Q8IVY1 113 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPXM2Q8N436 756 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNKPQ96T60 521 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM86C1Q9NVL1 165 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AIPL1Q9NZN9 384 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DMDP11532 3685 aa18.08■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITIH6Q6UXX5 1313 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PROB1E7EW31 1015 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAMTOR5O43504 91 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APOEP02649 317 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GBP1P32455 592 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MATKP42679 507 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTAPQ13126 283 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANGPT1Q15389 498 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C2CD6Q53TS8 623 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM217AQ8IXS0 508 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAT16Q8N8M0 369 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC30A5Q8TAD4 765 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDHB18PQ96TA0 734 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C11orf70Q9BRQ4 267 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGEF4Q9NR80 690 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RRN3Q9NYV6 651 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DEC1Q9P2X7 70 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STOML2Q9UJZ1 356 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STAP1Q9ULZ2 295 aa18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLGA8SH3BPF8 625 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CACNG3O60359 315 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TULP3O75386 442 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KAT7O95251 611 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGLV3-25P01717 112 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APODP05090 189 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNFAIP3P21580 790 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOS2P35228 1153 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC6A11P48066 632 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDSRQ06136 332 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLHL30Q0D2K2 578 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRF1Q5T601 910 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 Q6ZS52 159 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUDT18Q6ZVK8 323 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPEM1Q8N4L4 309 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BHMTQ93088 406 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC39A13Q96H72 371 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDIT4Q9NX09 232 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAM22Q9P0K1 906 aa18.06■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VPS13AQ96RL7 3174 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACSL4O60488 711 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF40O75150 1001 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PENKP01210 267 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CALB1P05937 261 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC2A3P11169 496 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRKCIP41743 596 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRIA2P42262 883 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCR3P51677 355 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBED6P86452 979 aa18.05■□□□□ 0.48
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP2R5DQ14738 602 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms