RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 MAP7D1Q3KQU3 841 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 SPDYCQ5MJ68 293 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 LPCAT2Q7L5N7 544 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 RLN3Q8WXF3 142 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 EDEM1Q92611 657 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 P2RY11Q96G91 374 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 KREMEN1Q96MU8 473 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC2A11Q9BYW1 496 aa29.01■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 FBXO21O94952 628 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 LATS1O95835 1130 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 GABRG2P18507 467 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 WASP42768 502 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 RGS7P49802 495 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 IL31Q6EBC2 164 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 MSANTD2Q6P1R3 559 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 CYP2U1Q7Z449 544 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM81BQ96LP2 452 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 ACOX2Q99424 681 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 SMOC1Q9H4F8 434 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 CD248Q9HCU0 757 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 STOML2Q9UJZ1 356 aa29■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 NCOR2Q9Y618 2525 aa28.99■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 MAP3K13O43283 966 aa28.99■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 GABBR2O75899 941 aa28.99■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 MEA1Q16626 185 aa28.99■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 MLKLQ8NB16 471 aa28.99■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 GOLGA1Q92805 767 aa28.99■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 RXFP3Q9NSD7 469 aa28.99■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa28.99■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 MPPE1Q53F39 396 aa28.98■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa28.98■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 DDI1Q8WTU0 396 aa28.98■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 UCMAQ8WVF2 138 aa28.98■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 ABCA7Q8IZY2 2146 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF217O75362 1048 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 LTFP02788 710 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 KRT5P13647 590 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 DPP6P42658 865 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 GEN1Q17RS7 908 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 STPG1Q5TH74 334 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 SART1O43290 800 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 RPL34P49207 117 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 ADGRF1Q5T601 910 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 SMYD5Q6GMV2 418 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 TCEAL6Q6IPX3 200 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 TRIM65Q6PJ69 517 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC36A4Q6YBV0 504 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 TCEAL3Q969E4 200 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa28.95■■■□□ 2.23
ANKRD54-203ENST00000407117 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 MED7O43513 233 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 CALCAP01258 141 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 GPD2P43304 727 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 ACADSBP45954 432 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 STARD3Q14849 445 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 RNF43Q68DV7 783 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 KIAA1211LQ6NV74 962 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 UNC45BQ8IWX7 931 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 FRMD1Q8N878 549 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 STK32AQ8WU08 396 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 MED15Q96RN5 788 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 EDEM2Q9BV94 578 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 STON1Q9Y6Q2 735 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 THADAQ6YHU6 1953 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 PIK3R2O00459 728 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 AP5Z1O43299 807 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 MSI1O43347 362 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 TIMM44O43615 452 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 IGLV3-27P01718 113 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 NDUFV2P19404 249 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 RING1Q06587 406 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 ENPP2Q13822 863 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 PPM1JQ5JR12 505 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 NUGGCQ68CJ6 796 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 GBP6Q6ZN66 633 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEFF1Q8IYR6 380 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 CLSTN2Q9H4D0 955 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 ELOVL2Q9NXB9 296 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 SPTBN2O15020 2390 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 LNP1A1A4G5 178 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 TM4SF5O14894 197 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 CREBRFQ8IUR6 639 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 SYT12Q8IV01 421 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 CLEC4CQ8WTT0 213 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 PIGKQ92643 395 aa28.93■■■□□ 2.22
ANKRD54-203ENST00000407117 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 171.3 ms