RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395038.6

SOS1-201, Transcript of SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOS1, Length 4,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1-201ENST00000395038 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 CCDC185Q8N715 623 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 MTBPQ96DY7 904 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 KIF12Q96FN5 646 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 SUFUQ9UMX1 484 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 AKT3Q9Y243 479 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 DERAQ9Y315 318 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 BPGMP07738 259 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 SCNN1AP37088 669 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 PPIL2Q13356 520 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 TUBB3Q13509 450 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 NAA25Q14CX7 972 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 TAF11Q15544 211 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ANO7Q6IWH7 933 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ZNF778Q96MU6 729 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 DTLQ9NZJ0 730 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.51□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 C5orf42Q9H799 3197 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 VCANP13611 3396 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 BIRC5O15392 142 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ATP6V1C1P21283 382 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 NR2C2P49116 596 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 RAP1GDS1P52306 607 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 E2F7Q96AV8 911 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 FAM136AQ96C01 138 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ZNF333Q96JL9 665 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ARMCX1Q9P291 453 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ASB14A6NK59 587 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 H0Y3Z8 333 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 TOMM70O94826 608 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ACADSP16219 412 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 GJA5P36382 358 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 CHI3L2Q15782 390 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 UNC93AQ86WB7 457 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 VPS52Q8N1B4 723 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 KRT36O76013 467 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 KRT38O76015 456 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 MBLAC2Q68D91 279 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ZNF410Q86VK4 478 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 STKLD1Q8NE28 680 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 NLRP7Q8WX94 980 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 SNTG2Q9NY99 539 aa6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 SPTLC1O15269 473 aa6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 GYG2O15488 501 aa6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 MAGEC1O60732 1142 aa6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 PSMG1O95456 288 aa6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 NPTXRO95502 500 aa6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 CCDC130P13994 396 aa6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 PAX7P23759 505 aa6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 MROH9Q5TGP6 573 aa6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.49□□□□□ -1.37
SOS1-201ENST00000395038 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms