RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 BAP1Q92560 729 aa22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.96■■□□□ 1.27
IGHV3-20-201ENST00000390606 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 GFRA2O00451 464 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 CAPN9O14815 690 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 KAT7O95251 611 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 LATS1O95835 1130 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGLV3-25P01717 112 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBX4P57082 545 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC6A3Q01959 620 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 FYB2Q5VWT5 728 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 NAA35Q5VZE5 725 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADAM32Q8TC27 787 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 NELL1Q92832 810 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM122AQ96E09 287 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC39A13Q96H72 371 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 SERPINB11Q96P15 392 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 SYNCQ9H7C4 482 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.95■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM170AA1A519 330 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM24O15164 1050 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 HSF2BPO75031 334 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 GRAP2O75791 330 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 APODP05090 189 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 NBL1P41271 181 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 GRIA2P42262 883 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 KDSRQ06136 332 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 ERICH1Q86X53 443 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEFB106AQ8N104 65 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 C18orf8Q96DM3 657 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLK2Q9NYY3 685 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEC1Q9P2X7 70 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.94■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 K7ESF4 209 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 IRAK2O43187 625 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARID5AQ03989 594 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 DCAF6Q58WW2 860 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADGRF1Q5T601 910 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 XYLT1Q86Y38 959 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 USP33Q8TEY7 942 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 BHMTQ93088 406 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 FBXO10Q9UK96 956 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYO6Q9UM54 1294 aa22.93■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATG13O75143 517 aa22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 DAB1O75553 588 aa22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 CISD3P0C7P0 127 aa22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 HOXC13P31276 330 aa22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCNN1AP37088 669 aa22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 PBX1P40424 430 aa22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 C2CD6Q53TS8 623 aa22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 TERB1Q8NA31 727 aa22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 AZIN2Q96A70 460 aa22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 FERP16591 822 aa22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNFRSF4P43489 277 aa22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEC13P55735 322 aa22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBASH3AP57075 661 aa22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 NADSYN1Q6IA69 706 aa22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 TSPY26PQ9H489 355 aa22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 R4GN57 208 aa22.91■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 PROB1E7EW31 1015 aa22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACSL4O60488 711 aa22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 MMP8P22894 467 aa22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC6A4P31645 630 aa22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF445P59923 1031 aa22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDK17Q00537 523 aa22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP2R5DQ14738 602 aa22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 EMC10Q5UCC4 262 aa22.9■■□□□ 1.26
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms