RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371935.6

REXO4-201, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene REXO4, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-201ENST00000371935 MYO16Q9Y6X6 1858 aa26.12■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 A6NNZ2 444 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 SYN3O14994 580 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 TUBB8Q3ZCM7 444 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 SLC45A4Q5BKX6 768 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 SCAMP5Q8TAC9 235 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 SERPINB12Q96P63 405 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 OLFM3Q96PB7 478 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 I6L893 689 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 TNFRSF10BO14763 440 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 ACTN2P35609 894 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 ARL4CP56559 192 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 LRRN4Q8WUT4 740 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 ADAM28Q9UKQ2 775 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.11■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 F9P00740 461 aa26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 GRIK1P39086 918 aa26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 SLC5A3P53794 718 aa26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 SEMA3BQ13214 749 aa26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 DPYSQ14117 519 aa26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 KCNJ11Q14654 390 aa26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 FNBP1LQ5T0N5 605 aa26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 KCNT2Q6UVM3 1135 aa26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 BEND5Q7L4P6 421 aa26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 ZBED8Q8IZ13 594 aa26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 SCLYQ96I15 445 aa26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 DGKIO75912 1065 aa26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 AMHP03971 560 aa26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 MDH1P40925 334 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 CXCR3P49682 368 aa26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 GUCY1A3Q02108 690 aa26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 TAC4Q86UU9 113 aa26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 TRIM62Q9BVG3 475 aa26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 COLEC11Q9BWP8 271 aa26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 MARCH5Q9NX47 278 aa26.09■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 ERICH4A6NGS2 130 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 E7ESA3 106 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 CHADO15335 359 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 CREB3O43889 395 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 MFSD11O43934 449 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 STAT4Q14765 748 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 MSS51Q4VC12 460 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 FAM182AQ5T1J6 154 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 RFX8Q6ZV50 586 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 NPAS4Q8IUM7 802 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 CCDC13Q8IYE1 715 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 FAM72CH0Y354 149 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 BANF1O75531 89 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 CXCL10P02778 98 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 FAM72AQ5TYM5 149 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 FAM72DQ6L9T8 149 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 FAM72BQ86X60 149 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 CCDC33Q8N5R6 958 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 HIPK3Q9H422 1215 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 HCSTQ9UBK5 93 aa26.08■■□□□ 1.77
REXO4-201ENST00000371935 PLXNA3P51805 1871 aa26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 HACD1B0YJ81 288 aa26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 HOXA2O43364 376 aa26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 IVLP07476 585 aa26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 SLC11A1P49279 550 aa26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 ARL13BQ3SXY8 428 aa26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 LRRC31Q6UY01 552 aa26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 GPR62Q9BZJ7 368 aa26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 RAB6BQ9NRW1 208 aa26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 DCLK1O15075 740 aa26.06■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 GCATO75600 419 aa26.06■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 IGLV3-25P01717 112 aa26.06■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 FAM171A1Q5VUB5 890 aa26.06■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 C4orf22Q6V702 233 aa26.06■■□□□ 1.76
REXO4-201ENST00000371935 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms