RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-204	ENST00000368210	JCHAIN	P01591	159 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ATP6V1C1	P21283	382 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	IRF6	O14896	467 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	LGALS2	P05162	132 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	APOA4	P06727	396 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	MIP	P30301	263 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	HAO1	Q9UJM8	370 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CDYL	Q9Y232	598 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	TIMM44	O43615	452 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	FKBP6	O75344	327 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	APOL2	Q9BQE5	337 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	IRF1	P10914	325 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	IL10	P22301	178 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	AADACL2	Q6P093	401 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PLD3	Q8IV08	490 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	DSE	Q9UL01	958 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF197	O14709	1029 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CALCA	P01258	141 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PTPN4	P29074	926 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ELK3	P41970	407 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	AMPD2	Q01433	879 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	GSTA3	Q16772	222 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	LYPLA2	O95372	231 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ALDH1A3	P47895	512 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ACAP1	Q15027	740 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZACN	Q401N2	412 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PGM2	Q96G03	612 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	KPNA6	O60684	536 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CYP1A2	P05177	515 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	HIST1H2AD	P20671	130 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	FMO1	Q01740	532 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	BLMH	Q13867	455 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	NCAN	O14594	1321 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	MYO1D	O94832	1006 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	UGCG	Q16739	394 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	FBXO32	Q969P5	355 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	AURKC	Q9UQB9	309 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PAX3	P23760	479 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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