RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368102.5

SNHG28-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SNHG28, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28-201ENST00000368102 NOTUMQ6P988 496 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 RSAD1Q9HA92 442 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 NRCAMQ92823 1304 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 CFAP69A5D8W1 941 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 GSC2O15499 205 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 DNAJC6O75061 913 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 ENDOD1O94919 500 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 IL4RP24394 825 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 RCN2Q14257 317 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PCGF5Q86SE9 256 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PPM1NQ8N819 430 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 BEST2Q8NFU1 509 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 NSL1Q96IY1 281 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 APOL6Q9BWW8 343 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.56□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 CYB561D2O14569 222 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 TM9SF1O15321 606 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PRPSAP2O60256 369 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 RECQL4O94761 1208 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 MT-ND3P03897 115 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 AKAP5P24588 427 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 GRIA1P42261 906 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 FKBP1BP68106 108 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 CDC42EP1Q00587 391 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 HIC1Q14526 733 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 KCNJ11Q14654 390 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 NOMO1Q15155 1222 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 CCDC14Q49A88 953 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 MPP5Q8N3R9 675 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 RNF217Q8TC41 542 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 USP29Q9HBJ7 922 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 ARMCX1Q9P291 453 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 HEY2Q9UBP5 337 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 CPA4Q9UI42 421 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 GJD2Q9UKL4 321 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 MAP3K13O43283 966 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PSMG1O95456 288 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SERPINB3P29508 390 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 CPA2P48052 419 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 RPS6KA3P51812 740 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 AP1B1Q10567 949 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 KRT72Q14CN4 511 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 GSTA3Q16772 222 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PQLC3Q8N755 202 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PLD5Q8N7P1 536 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 UCMAQ8WVF2 138 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 VPS11Q9H270 941 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 KCNK13Q9HB14 408 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SCN4AP35499 1836 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 GYG2O15488 501 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 GABBR2O75899 941 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 APRTP07741 180 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SESN3P58005 492 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG28-201ENST00000368102 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms