RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 KIAA0408Q6ZU52 694 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 USP49Q70CQ1 688 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 C11orf44Q8N8P7 122 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ZBTB9Q96C00 473 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC39A13Q96H72 371 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 RITA1Q96K30 269 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 C5orf34Q96MH7 638 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PRR25Q96S07 402 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SEMA4CQ9C0C4 833 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 OBP2BQ9NPH6 170 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PDGFCQ9NRA1 345 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A087WZ62 844 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 OR2W5A6NFC9 320 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 LGALS16A8MUM7 142 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 J3KTA2 159 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ACKR2O00590 384 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 FCHO1O14526 889 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 NPHP1O15259 732 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TUBB4AP04350 444 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ITGA5P08648 1049 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ARP10275 920 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 MATN1P21941 496 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ARHGAP25P42331 645 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CCT5P48643 541 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SEMA3BQ13214 749 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PTK2BQ14289 1009 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP1B1Q16678 543 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF569Q5MCW4 686 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM65Q6PI78 240 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC174Q6PII3 467 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 MYCT1Q8N699 235 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 C8orf58Q8NAV2 365 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CPT1BQ92523 772 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 RSC1A1Q92681 617 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR24Q96S15 920 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 RTKNQ9BST9 563 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 KATNAL1Q9BW62 490 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CIPCQ9C0C6 399 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PPCSQ9HAB8 311 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 USP29Q9HBJ7 922 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF521Q96K83 1311 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 AQP12BA6NM10 295 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 BTBD19C9JJ37 291 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 H7C1Q1 480 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIM38O00635 465 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 NPC1O15118 1278 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 EXOC3O60645 756 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 NBNO60934 754 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 USP12O75317 370 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MOSPD3O75425 235 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ACTL6BO94805 426 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 NTSR2O95665 410 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 FPR3P25089 353 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SERPINF1P36955 418 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MCM2P49736 904 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 FOXO1Q12778 655 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 BIRC3Q13489 604 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ACOX1Q15067 660 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 RPS6KA2Q15349 733 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 NFRKBQ6P4R8 1299 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms