RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALADP13716 330 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCB4P21439 1286 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMP8P22894 467 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTGER1P34995 402 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLCD1P51178 756 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFHR1Q03591 330 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF91Q05481 1191 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTKQ06187 659 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB30Q15771 203 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC146Q8IYE0 955 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM186BQ8IYM0 893 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGOQ8TEQ8 1089 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 GJA10Q969M2 543 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 STK33Q9BYT3 514 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 HELLSQ9NRZ9 838 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FNIP2Q9P278 1114 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRHO14718 337 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPEF2O14830 753 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLP2RO95838 553 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFS1P28331 727 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC8A1P32418 973 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS41P49754 854 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS13P62277 151 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSF1Q00613 529 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ID2Q02363 134 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CBFBQ13951 182 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSHL1Q14406 222 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 RABEP1Q15276 862 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELF2Q15723 593 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP9Q49MG5 647 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 DGKKQ5KSL6 1271 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SHC4Q6S5L8 630 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLMPQ8WWB7 406 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGKQ92643 395 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMM1Q92871 262 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 C18orf8Q96DM3 657 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCRL5Q96RD9 977 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARFGAP3Q9NP61 516 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 NLRC4Q9NPP4 1024 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC39A10Q9ULF5 831 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRYO14603 147 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDH17O14917 1159 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHHO43323 396 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLA2G6O60733 806 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLAUP00749 431 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGBP02675 491 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 THBS4P35443 961 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 STARD3Q14849 445 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 C10orf25Q5T742 122 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRCH2Q5VUJ6 765 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACSM6Q6P461 480 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 UEVLDQ8IX04 471 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACRBPQ8NEB7 543 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 SVIPQ8NHG7 77 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 MUL1Q969V5 352 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 COQ8BQ96D53 544 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 SENP7Q9BQF6 1050 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 TM2D2Q9BX73 214 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTMR4Q9NYA4 1195 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDC23Q9UJX2 597 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF521Q96K83 1311 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-552P-201ENST00000362869 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms