RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 IRGQQ8WZA9 623 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 BPIFA3Q9BQP9 254 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 OCEL1Q9H607 264 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 PLK2Q9NYY3 685 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ABCA7Q8IZY2 2146 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 SMTNL1A8MU46 457 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 THAP12O43422 761 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 MED7O43513 233 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ADAM23O75077 832 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ALDH1A2O94788 518 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO21O94952 628 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 EPN2O95208 641 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 LTFP02788 710 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CYBBP04839 570 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 SLC9A1P19634 815 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TGM1P22735 817 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 GNA15P30679 374 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CLCN6P51797 869 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 MYL5Q02045 173 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 APBA1Q02410 837 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TYRO3Q06418 890 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 NFKBIBQ15653 356 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ELF2Q15723 593 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 MEA1Q16626 185 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 MAN2A1Q16706 1144 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP44Q17R89 818 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 FYB2Q5VWT5 728 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 GJB7Q6PEY0 223 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM92Q6UXU6 159 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 FAM217AQ8IXS0 508 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CPXM2Q8N436 756 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 HMGB4Q8WW32 186 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA1Q92805 767 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 RMDN1Q96DB5 314 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 P2RY11Q96G91 374 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 LOXL4Q96JB6 756 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 HSFY1Q96LI6 401 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ANP32EQ9BTT0 268 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ST7Q9NRC1 585 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 CHD8Q9HCK8 2581 aa8□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 SPTBN2O15020 2390 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf72A6NCS6 295 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 BECN2A8MW95 431 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 PRRT4C9JH25 899 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 DCLK1O15075 740 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 HOXB2P14652 356 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 PON1P27169 355 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 NTSR1P30989 418 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 GBP1P32455 592 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 USP8P40818 1118 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 GPD2P43304 727 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 FOXK1P85037 733 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP8P85298 464 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CSRP2Q16527 193 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 PLK5Q496M5 336 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 MIIPQ5JXC2 388 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf74Q86VG3 221 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CHPFQ8IZ52 775 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 DDI1Q8WTU0 396 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 SHC3Q92529 594 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 FAM149B1Q96BN6 582 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 SPACA7Q96KW9 195 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 MIS12Q9H081 205 aa7.99□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.99□□□□□ -1.13
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