RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361198.9

LDB1-201, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LDB1, Length 2,285 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-201ENST00000361198 FAM163BP0C2L3 166 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 GOT1P17174 413 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 CA4P22748 312 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 RABGGTBP53611 331 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 MAP3K7CLP57077 242 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 SLC1A5Q15758 541 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 KCTD13Q8WZ19 329 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 SPOCK2Q92563 424 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 DHRS4Q9BTZ2 278 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 LRRC4Q9HBW1 653 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 CHST12Q9NRB3 414 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 ARL5CA6NH57 179 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 ATP5HO75947 161 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 AMPD1P23109 780 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 ADGRD1Q6QNK2 874 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 CXorf56Q9H5V9 222 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 TXLNGQ9NUQ3 528 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 FZD10Q9ULW2 581 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 USP3Q9Y6I4 520 aa23.4■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 DAB1O75553 588 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 FLT3LGP49771 235 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 SCNN1GP51170 649 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 SREBF2Q12772 1141 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 KLHL38Q2WGJ6 581 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 NT5C3BQ969T7 300 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 SPC25Q9HBM1 224 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 KRT82Q9NSB4 513 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 TRIM33Q9UPN9 1127 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 CHKBQ9Y259 395 aa23.39■■□□□ 1.34
LDB1-201ENST00000361198 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 KBTBD13C9JR72 458 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 CCND1P24385 295 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 ELF1P32519 619 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 NR2C2P49116 596 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 MGAT3Q09327 533 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 SETDB1Q15047 1291 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 SLC45A4Q5BKX6 768 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 HACE1Q8IYU2 909 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 LRRC8CQ8TDW0 803 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 KLC2Q9H0B6 622 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 MYLK2Q9H1R3 596 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 DTLQ9NZJ0 730 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 COX16Q9P0S2 106 aa23.39■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 CAPN15O75808 1086 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 APRTP07741 180 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 FAM200BP0CF97 657 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 TSHRP16473 764 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 NOS2P35228 1153 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 TKTL1P51854 596 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 LRRC37BQ96QE4 947 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 NPY6RQ99463 290 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 SYT15Q9BQS2 421 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 L3MBTL1Q9Y468 752 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 CA12O43570 354 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 ZWINTO95229 277 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 FCGRTP55899 365 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 ACCSLQ4AC99 568 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 BNIPLQ7Z465 357 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 DCAKDQ8WVC6 231 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 PCED1BQ96HM7 432 aa23.38■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 HTTP42858 3142 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 SEPT4O43236 478 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 ADAMTS4O75173 837 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 METTL18O95568 372 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 KRT4P19013 534 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 ARL4AP40617 200 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 LHX1P48742 406 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 PARP6Q2NL67 630 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 SPDYAQ5MJ70 313 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 DSTYKQ6XUX3 929 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 GPATCH11Q8N954 259 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 KCNK16Q96T55 309 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 LRMDAQ9H2I8 198 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 TMEM30AQ9NV96 361 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 GIT1Q9Y2X7 761 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.37■■□□□ 1.33
LDB1-201ENST00000361198 M0QYT0 321 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms