RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 UPP2O95045 317 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CHN2P52757 468 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 EML3Q32P44 896 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SV2CQ496J9 727 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CDK20Q8IZL9 346 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 NSMCE2Q96MF7 247 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 HPSEQ9Y251 543 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 UNC13BO14795 1591 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CBX6O95503 412 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CNPP09543 421 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 DDR1Q08345 913 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 QPRTQ15274 297 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 NR6A1Q15406 480 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 EHD4Q9H223 541 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 LDLRP01130 860 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 GLI1P08151 1106 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PAICSP22234 425 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 XRCC4Q13426 336 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 HLFQ16534 295 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SDE2Q6IQ49 451 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.31□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A087X0T9 212 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PLOD3O60568 738 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 MPOP05164 745 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 RAP1GAPP47736 663 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 STAT5BP51692 787 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ITGA1P56199 1179 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 RRN3Q9NYV6 651 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 NAGPAQ9UK23 515 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 F5H6K3 240 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 EXTL3O43909 919 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ECE2O60344 883 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ENDOD1O94919 500 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 KLRC3Q07444 240 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PLCL1Q15111 1095 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PRMT9Q6P2P2 845 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ZBTB46Q86UZ6 589 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 POMGNT2Q8NAT1 580 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PKNOX1P55347 436 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CITED4Q96RK1 184 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 22.8
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 NDUFAF1Q9Y375 327 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 TRAPPC3O43617 180 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 FNDC5Q8NAU1 212 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 YME1L1Q96TA2 773 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 TBCDQ9BTW9 1192 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 C9orf16Q9BUW7 83 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 DPY30Q9C005 99 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ACAD9Q9H845 621 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SPACA6W5XKT8 324 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PGM3O95394 542 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ITGB3P05106 788 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 S100A6P06703 90 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 SCRN3Q0VDG4 424 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 PDIA5Q14554 519 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 EMC2Q15006 297 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 CCDC185Q8N715 623 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 STK32AQ8WU08 396 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 TIPINQ9BVW5 301 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 TCF7L2Q9NQB0 619 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 KPNA5O15131 536 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 IL18RAPO95256 599 aa11.29□□□□□ -0.6
GTF3C1-201ENST00000356183 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms