RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 FAM72AQ5TYM5 149 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 FAM72DQ6L9T8 149 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 LRRC31Q6UY01 552 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 FAM72BQ86X60 149 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ANKMY2Q8IV38 441 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SCML4Q8N228 414 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 DTLQ9NZJ0 730 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 TRAPPC3O43617 180 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ACTN2P35609 894 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 NR2C2P49116 596 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ARL4CP56559 192 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 XRCC4Q13426 336 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 HIF1AQ16665 826 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SLC45A4Q5BKX6 768 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CEP57Q86XR8 500 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PKNOX2Q96KN3 472 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 B3GALT6Q96L58 329 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SLC9A7Q96T83 725 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PNPLA8Q9NP80 782 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PAK5Q9P286 719 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 TNFRSF10BO14763 440 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 AGTP01019 485 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 MDH1P40925 334 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PGFP49763 221 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SLC5A3P53794 718 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 MTM1Q13496 603 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 MFSD5Q6N075 450 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CAPN12Q6ZSI9 719 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 TAC4Q86UU9 113 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 STKLD1Q8NE28 680 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CCDC110Q8TBZ0 833 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 NTAN1Q96AB6 310 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SERPINB12Q96P63 405 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 GPR62Q9BZJ7 368 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 RRN3Q9NYV6 651 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ADAM28Q9UKQ2 775 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 NR2E3Q9Y5X4 410 aa18.52■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 MYO16Q9Y6X6 1858 aa18.52■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 MFSD11O43934 449 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 DGKIO75912 1065 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 SLC11A1P49279 550 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 DPYSQ14117 519 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 KCNJ11Q14654 390 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 CCDC38Q502W7 563 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 FAXCQ5TGI0 409 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 FAM171A1Q5VUB5 890 aa18.51■□□□□ 0.55
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ACTB-201ENST00000331789 LEKR1Q6ZMV7 388 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 RFX8Q6ZV50 586 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 TTC25Q96NG3 672 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 RAB6BQ9NRW1 208 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 FOXO6A8MYZ6 492 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 TCEA3O75764 348 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 F9P00740 461 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 ALDH2P05091 517 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 ABHD2P08910 425 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 CXCR3P49682 368 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 GPR15P49685 360 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.551e-10■□□□□ 9.7
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ACTB-201ENST00000331789 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 CRIPAKQ8N1N5 446 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 APBB2Q92870 758 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 OLFM3Q96PB7 478 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 HIPK3Q9H422 1215 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 RABEP2Q9H5N1 569 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 WDCPQ9H6R7 721 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 VPS37BQ9H9H4 285 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 MARCH5Q9NX47 278 aa18.51■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 TANC1Q9C0D5 1861 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 SYN3O14994 580 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 AIF1P55008 147 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 GPX6P59796 221 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 STAT4Q14765 748 aa18.5■□□□□ 0.55
ACTB-201ENST00000331789 BBS9Q3SYG4 887 aa18.5■□□□□ 0.55
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