RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC28BQ9BUN5 200 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 APOL6Q9BWW8 343 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 MROH8Q9H579 483 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 F8W8V4 182 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 H3BRB1 525 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ITGA2BP08514 1039 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 MAP7Q14244 749 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 MIS12Q9H081 205 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 VPS11Q9H270 941 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SLC7A8Q9UHI5 535 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 TM9SF1O15321 606 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ATP6V1G1O75348 118 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 CIB2O75838 187 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM63AO94886 807 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 MAGEA8P43361 318 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 RFX6Q8HWS3 928 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 NME8Q8N427 588 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 KCTD6Q8NC69 237 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 MZB1Q8WU39 189 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 KIF12Q96FN5 646 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SERAC1Q96JX3 654 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 BTBD19C9JJ37 291 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SMPD1P17405 629 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 PTK7Q13308 1070 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SURF1Q15526 300 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ACOT1Q86TX2 421 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 NETO2Q8NC67 525 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 MAF1Q9H063 256 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 DPP3Q9NY33 737 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SNTG2Q9NY99 539 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 MAGEC1O60732 1142 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 PGM3O95394 542 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 PFKMP08237 780 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ACTR3P61158 418 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 OR6B2Q6IFH4 312 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ACAD11Q709F0 780 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 KATNBL1Q9H079 304 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SETSIPP0DME0 302 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 PDIK1LQ8N165 341 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 PPCSQ9HAB8 311 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 USP18Q9UMW8 372 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 GABBR2O75899 941 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 FAAP100Q0VG06 881 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 MED21Q13503 144 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 SFT2D3Q587I9 215 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC38Q5VT99 294 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF554-201ENST00000317243 LPCAT4Q643R3 524 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 207.1 ms