RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298919.7

PDZRN4-201, Transcript of PDZ domain containing ring finger 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDZRN4, Length 3,411 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4-201ENST00000298919 FAM131BQ86XD5 332 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 CEP57Q86XR8 500 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 NT5C3BQ969T7 300 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 SKA1Q96BD8 255 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ZFP42Q96MM3 310 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ZNF778Q96MU6 729 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 CYTH2Q99418 400 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 VPS11Q9H270 941 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 EMCNQ9ULC0 261 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 FZD10Q9ULW2 581 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 MYLKQ15746 1914 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 FAM159BA6NKW6 160 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 A8MXQ7 604 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 KPNA7A9QM74 516 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 C2CD2LO14523 706 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 NRP1O14786 923 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 TM9SF1O15321 606 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 LPXNO60711 386 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 IGHA2P01877 340 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 P4HA1P13674 534 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 SDC4P31431 198 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 SNX17Q15036 470 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 CCL15Q16663 113 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 DGKDQ16760 1214 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 HHATQ5VTY9 493 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 SESTD1Q86VW0 696 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 PPM1NQ8N819 430 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 FAM13CQ8NE31 585 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 TTC8Q8TAM2 541 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 STK32AQ8WU08 396 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 APOPT1Q96IL0 206 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ZNF570Q96NI8 536 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 DERAQ9Y315 318 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 PEX11AO75192 247 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ANP32DO95626 131 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 GNAZP19086 355 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 CCNFP41002 786 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 LILRA4P59901 499 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 BEX3Q00994 111 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 WASHC5Q12768 1159 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 MIOSQ9NXC5 875 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 PAK5Q9P286 719 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 PLLPQ9Y342 182 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 CDH23Q9H251 3354 aa6.7□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 SCN4AP35499 1836 aa6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 MYADML2A6NDP7 307 aa6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 HAS3O00219 553 aa6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 APOEP02649 317 aa6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 CD1EP15812 388 aa6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 TSHRP16473 764 aa6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 PHBP35232 272 aa6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 TFDP2Q14188 446 aa6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 RINLQ6ZS11 566 aa6.69□□□□□ -1.34
PDZRN4-201ENST00000298919 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms