RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MED8Q96G25 268 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 DPH1Q9BZG8 443 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM9Q9C026 710 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CD93Q9NPY3 652 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 KNTC1P50748 2209 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM92AA1XBS5 289 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC72A6NJI9 287 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TISP43B9A030 160 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BQV1 296 aa8.28□□□□□ -1.08
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PGGT1B-201ENST00000296642 HCRTO43612 131 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PHACTR2O75167 634 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CISD3P0C7P0 127 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.28□□□□□ -1.08
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF445P59923 1031 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 IL9RQ01113 521 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 BNC1Q01954 994 aa8.28□□□□□ -1.08
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PGGT1B-201ENST00000296642 ENPP2Q13822 863 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF234Q14588 700 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC142Q17RM4 750 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SGO2Q562F6 1265 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 XKR5Q6UX68 686 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.28□□□□□ -1.08
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PGGT1B-201ENST00000296642 BIRC7Q96CA5 298 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 FIZ1Q96SL8 496 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CYLDQ9NQC7 956 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 OLFML3Q9NRN5 406 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 IL37Q9NZH6 218 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 STK17AQ9UEE5 414 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SEPT3Q9UH03 358 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SUN2Q9UH99 717 aa8.28□□□□□ -1.08
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PGGT1B-201ENST00000296642 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA8JA6NMD2 632 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN3O60637 253 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 AP1G2O75843 785 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 IDEP14735 1019 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 ACADVLP49748 655 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 COPAP53621 1224 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 INHBCP55103 352 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVPABLB-1P60509 514 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 VAC14Q08AM6 782 aa8.27□□□□□ -1.09
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PGGT1B-201ENST00000296642 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 USP49Q70CQ1 688 aa8.27□□□□□ -1.09
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PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf38Q8TB03 319 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 DDI1Q8WTU0 396 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.27□□□□□ -1.09
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PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 THSD1Q9NS62 852 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 PLK2Q9NYY3 685 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.27□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 MAST4O15021 2626 aa8.26□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPC4 97 aa8.26□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN5O00501 218 aa8.26□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNK3O14649 394 aa8.26□□□□□ -1.09
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