RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 CPXM2Q8N436 756 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 UCMAQ8WVF2 138 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 GSDMAQ96QA5 445 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 WASF3Q9UPY6 502 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 PI4KAP42356 2102 aa20.54■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 NPC1O15118 1278 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 SPINK2P20155 84 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 IL12RB1P42701 662 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 BCAT1P54687 386 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 SEMA3BQ13214 749 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 FUT11Q495W5 492 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 DDI1Q8WTU0 396 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 PLD4Q96BZ4 506 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 HESX1Q9UBX0 185 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.53■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 PROS1P07225 676 aa20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 CD19P15391 556 aa20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF132P52740 706 aa20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ADIGQ0VDE8 80 aa20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 BST2Q10589 180 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ENPP2Q13822 863 aa20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP33O14559 1287 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 OPHN1O60890 802 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 C1QTNF9P0C862 333 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 CD6P30203 668 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 LRMPQ12912 555 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF234Q14588 700 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 PIP4P1Q86T03 277 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 OR2I1PQ8NGU4 316 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 UBA3Q8TBC4 463 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 RNF139Q8WU17 664 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 FOXJ1Q92949 421 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SLC35C1Q96A29 364 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 CIPCQ9C0C6 399 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 USP24Q9UPU5 2620 aa20.51■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SMC2O95347 1197 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SYPP08247 313 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 VDRP11473 427 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 MAOBP27338 520 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC63Q05C16 580 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 E2F5Q15329 346 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 UBR7Q8N806 425 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA20Q8TB22 786 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 EDEM1Q92611 657 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SMARCE1Q969G3 411 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.49■□□□□ 0.87
CXCL3-201ENST00000296026 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.49■□□□□ 0.87
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