RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 GBP1P32455 592 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 MAGEA1P43355 309 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 GRM2Q14416 872 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC14Q49A88 953 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 STRADAQ7RTN6 431 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 YAF2Q8IY57 180 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 OSCP1Q8WVF1 389 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 OTUB2Q96DC9 234 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 CFAP57Q96MR6 1250 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 TBCBQ99426 244 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 FAM83CQ9BQN1 747 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 TRPV5Q9NQA5 729 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D14Q9P2M4 693 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 UVRAGQ9P2Y5 699 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 MYO1AQ9UBC5 1043 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 DUSP12Q9UNI6 340 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF510Q9Y2H8 683 aa13.78□□□□□ -0.2
CCDC42-201ENST00000293845 ARNTLO00327 626 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 KLKB1P03952 638 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 HMBSP08397 361 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 IRF1P10914 325 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 SRFP11831 508 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 CCZ1BP86790 482 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 OGDHQ02218 1023 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 PPP2R5DQ14738 602 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 TCEAL1Q15170 157 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 PDGFRLQ15198 375 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 UNC45BQ8IWX7 931 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 IRF7Q92985 503 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 AZIN2Q96A70 460 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 ASIC4Q96FT7 647 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 CNPY3Q9BT09 278 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 NUP85Q9BW27 656 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 PIGVQ9NUD9 493 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 STOML2Q9UJZ1 356 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa13.77□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 F5P12259 2224 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 KCNU1A8MYU2 1149 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 CCP110O43303 1012 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 NRDCO43847 1150 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 MTA2O94776 668 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 SLC2A3P11169 496 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 GDI1P31150 447 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 CCR1P32246 355 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 RDXP35241 583 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 IFNAR2P48551 515 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 CXCR3P49682 368 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 DEUP1Q05D60 604 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC173Q0VFZ6 552 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 MTA1Q13330 715 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 EML3Q32P44 896 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 BRMS1LQ5PSV4 323 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 BBS7Q8IWZ6 715 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 RHOT2Q8IXI1 618 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 FAM217AQ8IXS0 508 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 RFFLQ8WZ73 363 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 DNASE1L2Q92874 299 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM7Q9C029 511 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 BRD9Q9H8M2 597 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 WNT6Q9Y6F9 365 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 VCANP13611 3396 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 MIA3Q5JRA6 1907 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 DOCK4Q8N1I0 1966 aa13.76□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 NARSO43776 548 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 APOEP02649 317 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 DESP17661 470 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 PSMA2P25787 234 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 VAV2P52735 878 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 HDAC4P56524 1084 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 KRT83P78385 493 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 ATP11AP98196 1134 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 PFKPQ01813 784 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 NME3Q13232 169 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 ACAP1Q15027 740 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 DENND1CQ8IV53 801 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 CPXM2Q8N436 756 aa13.75□□□□□ -0.21
CCDC42-201ENST00000293845 ACRBPQ8NEB7 543 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms