RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 TRHDEQ9UKU6 1024 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 TCHHQ07283 1943 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 KCNA4P22459 653 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 CCR1P32246 355 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 PRKAA1Q13131 559 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 SGO1Q5FBB7 561 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 RIOX2Q8IUF8 465 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 RBBP8Q99708 897 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 CAAP1Q9H8G2 361 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 CRLS1Q9UJA2 301 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 DDX5P17844 614 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 POU6F1Q14863 301 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 SYTL3Q4VX76 610 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 DEFB107AQ8IZN7 70 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 RASGEF1CQ8N431 466 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 ALLCQ8N6M5 410 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF333Q96JL9 665 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 MFSD14AQ96MC6 490 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 ECSITQ9BQ95 431 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 A0A096LPK6 155 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 H0Y626 953 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM16O95361 564 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 CAPSQ13938 189 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 BBS12Q6ZW61 710 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 RNF112Q9ULX5 631 aa18.09■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 TBC1D4O60343 1298 aa18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 DDHD2O94830 711 aa18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 EPHX2P34913 555 aa18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 RPL22P35268 128 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 EFEMP1Q12805 493 aa18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 TTLL9Q3SXZ7 439 aa18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 SLC45A4Q5BKX6 768 aa18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 TAGAPQ8N103 731 aa18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
SCARB2-201ENST00000264896 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 E7ENQ6 273 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 MAFO75444 373 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ZCCHC18P0CG32 403 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 TPH1P17752 444 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 AXLP30530 894 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 CD151P48509 253 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 NPY2RP49146 381 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 CDK16Q00536 496 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 NT5MQ9NPB1 228 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 NDUFA13Q9P0J0 144 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 STARD13Q9Y3M8 1113 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 PIK3C2AO00443 1686 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 EVPLLA8MZ36 301 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 FKBP9O95302 570 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 PTK2BQ14289 1009 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 UGCGQ16739 394 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 FKBP9P1Q75LS8 142 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 EXOC3L1Q86VI1 746 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 COG4Q9H9E3 785 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 IRAK4Q9NWZ3 460 aa18.08■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 CHADO15335 359 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 SNX30Q5VWJ9 437 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 RRM2BQ7LG56 351 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 POLNQ7Z5Q5 900 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 KCNMB4Q86W47 210 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 LGALS2P05162 132 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ITGAVP06756 1048 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ADORA2AP29274 412 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 MARC1Q5VT66 337 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 UNC93AQ86WB7 457 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 KYQ8NBH2 561 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 FAM162AQ96A26 154 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 HEATR9A2RTY3 570 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 CHKAP35790 457 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ST8SIA6P61647 398 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 KRT72Q14CN4 511 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 OVOS1Q6IE37 1185 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 IZUMO2Q6UXV1 221 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 HASPINQ8TF76 798 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 CPNE1Q99829 537 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 C17orf80Q9BSJ5 609 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ETNK2Q9NVF9 386 aa18.07■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ARMCX1Q9P291 453 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms