RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 FAM187BQ17R55 369 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 INSCQ1MX18 579 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 MAGEB5Q9BZ81 275 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 HACD3Q9P035 362 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 TMEM114B3SHH9 223 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 GIPC1O14908 333 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 PGK2P07205 417 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 AIF1P55008 147 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 GSTA3Q16772 222 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 AAGABQ6PD74 315 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ILDR2Q71H61 639 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 TTC8Q8TAM2 541 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 USP6NLQ92738 828 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 FAR2Q96K12 515 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 GPAMQ9HCL2 828 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 SLC17A7Q9P2U7 560 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 CDYLQ9Y232 598 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 E7ESA3 106 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 LGALS2P05162 132 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 PDGFRBP09619 1106 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 CPA3P15088 417 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 SCNN1AP37088 669 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 PTPN9P43378 593 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 PSMC4P43686 418 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 BMPR2Q13873 1038 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 DCAF6Q58WW2 860 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 BBS5Q8N3I7 341 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 FAM84AQ96KN4 292 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 TEPSINQ96N21 525 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 VAT1Q99536 393 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.12□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ADGRA2Q96PE1 1338 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 C2CD4BA6NLJ0 364 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 TYROBPO43914 113 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 FAM200BP0CF97 657 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 POLE2P56282 527 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 SLC18A2Q05940 514 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 SLC30A9Q6PML9 568 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 FAM192AQ9GZU8 254 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 WDR27A2RRH5 827 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 GSC2O15499 205 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ANXA9O76027 345 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 CFHP08603 1231 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 GPX6P59796 221 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 PPIL2Q13356 520 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 LAMB3Q13751 1172 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 VGLL4Q14135 290 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 GRIK4Q16099 956 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ACCSLQ4AC99 568 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ADGRF2Q8IZF7 708 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 PLD5Q8N7P1 536 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 RFWD2Q8NHY2 731 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 CALML6Q8TD86 181 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.11□□□□□ -0.95
HERC3-201ENST00000264345 MTFR1LQ9H019 292 aa9.11□□□□□ -0.95
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