RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 DEFB119Q8N690 84 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 SLC35C1Q96A29 364 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 PLD4Q96BZ4 506 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 SLC6A14Q9UN76 642 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CYP8B1Q9UNU6 501 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 RAD54BQ9Y620 910 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 WASH3PC4AMC7 463 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 PSMA7O14818 248 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ENGP17813 658 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R2P41236 205 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 RNF139Q8WU17 664 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 P2RY11Q96G91 374 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 MRGPRX1Q96LB2 322 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 TULP2O00295 520 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 GIPC1O14908 333 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 NDUFS2O75306 463 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CFIP05156 583 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 HARS2P49590 506 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 LRMPQ12912 555 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 GEN1Q17RS7 908 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 UBA3Q8TBC4 463 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 DDI1Q8WTU0 396 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ERLEC1Q96DZ1 483 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CEP63Q96MT8 703 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CHD8Q9HCK8 2581 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 PMM2O15305 246 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 TIMM44O43615 452 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 SERPINF2P08697 491 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 SETSIPP0DME0 302 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 MAPK8P45983 427 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 FMO5P49326 533 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ADIGQ0VDE8 80 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 CETN1Q12798 172 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 MPPE1Q53F39 396 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 FAM217AQ8IXS0 508 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 SLC32A1Q9H598 525 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 LAMA1P25391 3075 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD8-201ENST00000250495 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 O00370 1275 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 PAEPP09466 180 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 ENPP2Q13822 863 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 SCML4Q8N228 414 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 UBR7Q8N806 425 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 FOXJ1Q92949 421 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 NT5C1BQ96P26 610 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.01■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 YJEFN3A6XGL0 299 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 E7ENQ6 273 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 IL12RB1P42701 662 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF445P59923 1031 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 FUT11Q495W5 492 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 ISM2Q6H9L7 571 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM270Q6UE05 265 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 RGL4Q8IZJ4 473 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 HDDC3Q8N4P3 179 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 EDEM1Q92611 657 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 HSPA12BQ96MM6 686 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 CAPN10Q9HC96 672 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 ITM2CQ9NQX7 267 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 PCNX2A6NKB5 2137 aa22■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 P4HA2O15460 535 aa21.99■■□□□ 1.11
NEDD8-201ENST00000250495 KRT37O76014 449 aa21.99■■□□□ 1.11
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