RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 GAD2Q05329 585 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 RING1Q06587 406 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TCF15Q12870 199 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 NNTQ13423 1086 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 DCAF6Q58WW2 860 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TRNP1Q6NT89 227 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TPGS1Q6ZTW0 290 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 CPXM2Q8N436 756 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB11Q96P15 392 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 CHRDQ9H2X0 955 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TLR6Q9Y2C9 796 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 A0A0A0MRY4 1105 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 CAPN9O14815 690 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 IRAK2O43187 625 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 DAB1O75553 588 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 CCDC172P0C7W6 258 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 FYB2Q5VWT5 728 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 HGSNATQ68CP4 663 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 SFTPA1Q8IWL2 248 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 NT5C3BQ969T7 300 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-201ENST00000236273 TRIM24O15164 1050 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SKILP12757 684 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 NOS2P35228 1153 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 HARS2P49590 506 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ASIC2Q16515 512 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 DGKKQ5KSL6 1271 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZS52 159 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 NAT16Q8N8M0 369 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 AZIN2Q96A70 460 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 C11orf70Q9BRQ4 267 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 KCNH6Q9H252 994 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 FBXO10Q9UK96 956 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 CACNA1HO95180 2353 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 K7EQS6 105 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 LATS1O95835 1130 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 PENKP01210 267 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 TYRP14679 529 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 DRD1P21728 446 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 CHKAP35790 457 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 FLT3P36888 993 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 MATKP42679 507 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA9P43362 315 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ZBED6P86452 979 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 MTAPQ13126 283 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ANO4Q32M45 955 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 NADSYN1Q6IA69 706 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 MAMSTRQ6ZN01 415 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 MON1BQ7L1V2 547 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 UNC45BQ8IWX7 931 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 NPY6RQ99463 290 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 BBS2Q9BXC9 721 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 C2orf42Q9NWW7 574 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA8SH3BPF8 625 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.32e-7■□□□□ 11.1
SYF2-201ENST00000236273 CBFA2T2O43439 604 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 CACNG3O60359 315 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 TULP3O75386 442 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 CISD3P0C7P0 127 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 CASP14P31944 242 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 GSCP56915 257 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 CDK17Q00537 523 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ADGRF1Q5T601 910 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 NUGGCQ68CJ6 796 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ACAD10Q6JQN1 1059 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 PKN3Q6P5Z2 889 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SARM1Q6SZW1 724 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 ARCQ7LC44 396 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 BNIPLQ7Z465 357 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 C1orf210Q8IVY1 113 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 VSTM4Q8IW00 320 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 SYNPOQ8N3V7 929 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 IQCDQ96DY2 449 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 PNKPQ96T60 521 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-201ENST00000236273 PLK2Q9NYY3 685 aa23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms