RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa10.46□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ATAD3BQ5T9A4 648 aa10.46□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 AHI1Q8N157 1196 aa10.46□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP10.45□□□□□ -0.743e-9■■■■■ 46.1
TTL-201ENST00000233336 ADCY6O43306 1168 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 GUCY1B2O75343 617 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FOPNLQ96NB1 174 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 APOL2Q9BQE5 337 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 VIL1P09327 827 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FGD2Q7Z6J4 655 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 CNPY3Q9BT09 278 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 DNPEPQ9ULA0 475 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 MGAT5Q09328 741 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 MCOLN2Q8IZK6 566 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FBXW4P57775 412 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 CHID1Q9BWS9 393 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 KRT84Q9NSB2 600 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 MED26O95402 600 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 CHRM3P20309 590 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 PRIM2P49643 509 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FCHO2Q0JRZ9 810 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 DGUOKQ16854 277 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 DHDDSQ86SQ9 333 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SLC22A9Q8IVM8 553 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 KAZALD1Q96I82 304 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 C17orf75Q9HAS0 396 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 WWOXQ9NZC7 414 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 AADACL2Q6P093 401 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FAM172AQ8WUF8 416 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FAM136AQ96C01 138 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 WDR27A2RRH5 827 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ZNF662Q6ZS27 426 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 GIPC3Q8TF64 312 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SPASTQ9UBP0 616 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FAM45BPQ6NSW5 357 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 MOSPD1Q9UJG1 213 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SIK3Q9Y2K2 1263 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 A8MUI8 341 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 PDZK1Q5T2W1 519 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 VPS33AQ96AX1 596 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ABLIM1O14639 778 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 GPRC5DQ9NZD1 345 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ACOT9Q9Y305 439 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 NCALDP61601 193 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 TKFCQ3LXA3 575 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ZNF34Q8IZ26 560 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FAM20BO75063 409 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 MT-CO1P00395 513 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 CCT8P50990 548 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 GSTA3Q16772 222 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 WFS1O76024 890 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 AMPD2Q01433 879 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 VAC14Q08AM6 782 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 PDK4Q16654 411 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 EXOC3L1Q86VI1 746 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 EID3Q8N140 333 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 DLG3Q92796 817 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 DGCR6LQ9BY27 220 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 MUC3BQ9H195 1237 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SERPIND1P05546 499 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ANKS3Q6ZW76 656 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ULK2Q8IYT8 1036 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FIG4Q92562 907 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 RCCD1A6NED2 376 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 FDX1P10109 184 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 ATG14Q6ZNE5 492 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 DIP2BQ9P265 1576 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 AMHR2Q16671 573 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 PGS1Q32NB8 556 aa10.44□□□□□ -0.74
TTL-201ENST00000233336 TTC27Q6P3X3 843 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms