RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 CRHR1P34998 444 aa27.95■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 WASHC5Q12768 1159 aa27.95■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 TUBB3Q13509 450 aa27.95■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 CUL3Q13618 768 aa27.95■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC14Q49A88 953 aa27.95■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 ATG14Q6ZNE5 492 aa27.95■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 FAM172AQ8WUF8 416 aa27.95■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 SIGLEC10Q96LC7 697 aa27.95■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 MINDY3Q9H8M7 445 aa27.95■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 THAP1Q9NVV9 213 aa27.95■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 OPHN1O60890 802 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 PEX2P28328 305 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 ADORA2AP29274 412 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 GMPRP36959 345 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 JADE1Q6IE81 842 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 PCDH18Q9HCL0 1135 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 HOXC10Q9NYD6 342 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 ZBTB42B2RXF5 422 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 PROCP04070 461 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 AOC1P19801 751 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 AQP4P55087 323 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF534Q76KX8 674 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 GSDMBQ8TAX9 411 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 C1orf21Q9H246 121 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 MKS1Q9NXB0 559 aa27.94■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 PCNTO95613 3336 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 GSRP00390 522 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 CBLBQ13191 982 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 LAMB3Q13751 1172 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 PDSS2Q86YH6 399 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 GPR25O00155 361 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 FKBP6O75344 327 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 VDRP11473 427 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 CRADDP78560 199 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 DCAF15Q66K64 600 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 ISLR2Q6UXK2 745 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 ILDR2Q71H61 639 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 C2orf40Q9H1Z8 148 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 DNAJB4Q9UDY4 337 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 ANK1P16157 1881 aa27.93■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 LOC100653049A0A140TA62 436 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 FAM159BA6NKW6 160 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 ZMPSTE24O75844 475 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 KRT34O76011 436 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 IQCF3P0C7M6 154 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 TGM2P21980 687 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 CCNIQ14094 377 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 PDK2Q15119 407 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 TBCCQ15814 346 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 C12orf29Q8N999 325 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 EPAS1Q99814 870 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 FZD8Q9H461 694 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 E2F8A0AVK6 867 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 C19orf81C9J6K1 198 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 GRIA2P42262 883 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 DLG1Q12959 904 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 STK32BQ9NY57 414 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 HSDL1Q3SXM5 330 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 BOLA3Q53S33 107 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 RABGAP1LQ5R372 815 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 MBLAC2Q68D91 279 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 MAVSQ7Z434 540 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 JDP2Q8WYK2 163 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 PNPOQ9NVS9 261 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 TSPAN16Q9UKR8 245 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 EMCNQ9ULC0 261 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 BIRC5O15392 142 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 SIN3BO75182 1162 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 STK10O94804 968 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 MAGEA6P43360 314 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 NDST1P52848 882 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 ACAD11Q709F0 780 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 APBB2Q92870 758 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 LRRC39Q96DD0 335 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 OCEL1Q9H607 264 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 DOCK1Q14185 1865 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 IL18RAPO95256 599 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 SLC1A6P48664 564 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 COPAP53621 1224 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 SLC9A4Q6AI14 798 aa27.91■■■□□ 2.06
FAM149A-201ENST00000227065 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms