RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216268.5

ZBED4-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED4, Length 6,893 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4-201ENST00000216268 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 ATG16L2Q8NAA4 619 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 NAGPAQ9UK23 515 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 PHF24Q9UPV7 400 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 E2F8A0AVK6 867 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 MAGEC1O60732 1142 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 IFI30P13284 250 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 CYP2R1Q6VVX0 501 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC126Q96EE4 140 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 TLR10Q9BXR5 811 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 UGT2B28Q9BY64 529 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 WDR41Q9HAD4 459 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 STON1Q9Y6Q2 735 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED4-201ENST00000216268 C5orf58C9J3I9 102 aa11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PRKD3O94806 890 aa11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 YES1P07947 543 aa11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 CYP2U1Q7Z449 544 aa11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 ASB12Q8WXK4 309 aa11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 NSMCE2Q96MF7 247 aa11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 TCF12Q99081 682 aa11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 NUDT5Q9UKK9 219 aa11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa11.65□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 TMEM114B3SHH9 223 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PSMD3O43242 534 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 C11orf91Q3C1V1 193 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 AGKQ53H12 422 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 ITPKCQ96DU7 683 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PIGSQ96S52 555 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 SEPHS2Q99611 448 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PRKAG3Q9UGI9 489 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 GIT1Q9Y2X7 761 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 F8W810 466 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 FBP2O00757 339 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 HAT1O14929 419 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 INPP4BO15327 924 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PHC2Q8IXK0 858 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 VPS37AQ8NEZ2 397 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 TFECO14948 347 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 ATP9BO43861 1147 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PSAPP07602 524 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 NPTX2P47972 431 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 IFT172Q9UG01 1749 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 A0A087X0T9 212 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 POTEMA6NI47 508 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 STMND1H3BQB6 276 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 UBDO15205 165 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 TMCC2O75069 709 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 TCP10Q12799 353 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PP2D1A8MPX8 630 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 SEPHS1P49903 392 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 ERLEC1Q96DZ1 483 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 KIFC1Q9BW19 673 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 SERPINA6P08185 405 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 MAPK12P53778 367 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 EBF3Q9H4W6 596 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 CDH9Q9ULB4 789 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 EMSYQ7Z589 1322 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PRKCBP05771 671 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 RRM2P31350 389 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 SDC4P31431 198 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 SULT1C3Q6IMI6 304 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 SZRD1Q7Z422 152 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 FAM47BQ8NA70 645 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 DMRTB1Q96MA1 342 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 MAF1Q9H063 256 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 RIBC2Q9H4K1 309 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED4-201ENST00000216268 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms