RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053729.13

Pdss1-201, Transcript of Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdss1, Length 1,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Zscan5bB2RTN3 468 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pja1O55176 578 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cldn2O88552 230 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 RhoP15409 348 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 FasP25446 327 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rfx2P48379 717 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Kcnd1Q03719 651 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rnf10Q3UIW5 804 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pla2g4dQ50L43 825 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Spdye4bQ8CDE8 236 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Acsl5Q8JZR0 683 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fbxo21Q8VDH1 627 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fam3aQ9D8T0 230 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 DmgdhQ9DBT9 869 aa25.08■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ubn1Q4G0F8 1135 aa25.07■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Klra5Q60652 266 aa25.07■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa25.07■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Bend7Q8BSV3 434 aa25.07■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa25.07■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gpr153Q8K0Z9 631 aa25.07■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Nup58Q8R332 587 aa25.07■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 CatsperzQ9CQP8 194 aa25.07■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 LrgukQ9D5S7 820 aa25.07■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Btbd18A0A0A6YY25 723 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Vmn2r84D3YWE3 849 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Serpinb9O08797 374 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Syn1O88935 706 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rasgrf1P27671 1262 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Sox1P53783 391 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Zfp791Q497V9 528 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Hsf5Q5ND04 624 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cxcl17Q5UW37 119 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Impg2Q80XH2 1243 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Zdhhc7Q91WU6 308 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mlf2Q99KX1 247 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 SardhQ99LB7 919 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Necab3Q9D6J4 353 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mroh9G5E8L9 891 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Soat2O88908 525 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Prf1P10820 554 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Lig3P97386 1015 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 MyzapQ3UIJ9 466 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 KrtdapQ3V2T4 102 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 SynaQ5G5D5 617 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fnbp1Q80TY0 616 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Q8BHR8 331 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fbxo9Q8BK06 437 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Parp10Q8CIE4 960 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Spata17Q9D552 379 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Jbts17Q8CE72 3214 aa25.05■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Prr22F6TNE3 422 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 CraddO88843 199 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Coro1aO89053 461 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Pim1P06803 397 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ttf2Q5NC05 1138 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Zbtb17Q60821 794 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Baiap3Q80TT2 1134 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Epb41l5Q8BGS1 731 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Abi3Q8BYZ1 367 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Afap1l1Q8BZI0 768 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cd209bQ8CJ91 325 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Mtrf1Q8K126 446 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Rnf34Q99KR6 376 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Prl2a1Q9JHK0 228 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Grk1Q9WVL4 564 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Fam71aB7XG49 585 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Dthd1E9PZX1 795 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 RaxO35602 342 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ccnb1P24860 430 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Nfkb1P25799 971 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Nudt18Q3U2V3 323 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Taar7eQ5QD09 358 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Vav2Q60992 868 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Creb3Q61817 404 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ctdp1Q7TSG2 960 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Noc4lQ8BHY2 516 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Emid1Q91VF5 444 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Ggt7Q99JP7 662 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 AdprmQ99KS6 340 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Susd3Q9D176 269 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Tubd1Q9R1K7 455 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Adamts20P59511 1906 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gm13089A2AGW7 455 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 9230113P08RikD3YWX3 137 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Kctd18E0CZ26 429 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 NoctO35710 429 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Cyp8b1O88962 500 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 JundP15066 341 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Hoxd12P23812 268 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 MsnP26041 577 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 MlipQ5FW52 269 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Gpr17Q6NS65 339 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 SpopQ6ZWS8 374 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdss1-201ENSMUST00000053729 Olfr698Q7TRN4 311 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.4 ms