RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ly9Q01965 654 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Msx2Q03358 267 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grid2ipQ0QWG9 1203 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdss1Q33DR2 409 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CblbQ3TTA7 982 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nxpe4Q52KP5 543 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pde1aQ61481 565 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arl13bQ640N2 427 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acot5Q6Q2Z6 421 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zpbp2Q6X786 326 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrgprb8Q7TN51 330 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LdhdQ7TNG8 484 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Panx3Q8CEG0 392 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mamdc2Q8CG85 686 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim66Q924W6 1242 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pacsin3Q99JB8 424 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wars2Q9CYK1 360 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cldn22Q9D7U6 220 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Efhc1Q9D9T8 648 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scyl3Q9DBQ7 735 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NumbQ9QZS3 653 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tle6Q9WVB3 581 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fibcd1A2AV25 459 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp990B1AVN5 605 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PiggD3Z3Y1 983 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kifc5bE9PUA5 672 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Efna5O08543 228 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2j6O54750 501 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 UmpsP13439 481 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cap1P40124 474 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sparcl1P70663 650 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc74bQ14BP6 391 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smyd5Q3TYX3 416 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gcnt3Q5JCT0 437 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddr2Q62371 854 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Htr1aQ64264 421 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc9a4Q8BUE1 797 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf467Q8JZL0 594 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trappc12Q8K2L8 797 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cnot6Q8K3P5 557 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdh18Q8VHR0 1134 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddx1Q91VR5 740 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chst12Q99LL3 419 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GsdmcQ99NB5 468 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Med21Q9CQ39 144 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim42Q9D2H5 723 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CabyrQ9D424 453 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbx20Q9ES03 445 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dmap1Q9JI44 468 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C1qtnf1Q9QXP7 281 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sf3b1Q99NB9 1304 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 D3Z070 196 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr600E9PUN7 314 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3187M0QWW3 260 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SpibO35906 267 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LgmnO89017 435 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lta4hP24527 611 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psma2P49722 234 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp6v1b2P62814 511 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fmo3P97501 534 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb16Q3UQ17 673 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mfhas1Q3V1N1 1048 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrkciQ62074 595 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scube1Q6NZL8 1018 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Skiv2lQ6NZR5 1244 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gucy2gQ6TL19 1100 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 WtipQ7TQJ8 398 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr150Q8BL07 427 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CherpQ8CGZ0 936 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem82Q8R115 356 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Def8Q99J78 448 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 QpctQ9CYK2 362 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Actrt2Q9D9L5 377 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcb9Q9JJ59 762 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Angptl2Q9R045 493 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GghQ9Z0L8 317 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5538W4VSP6 401 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nup210lQ9D2F7 1881 aa6.81□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm15155B1B034 138 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Osbpl8B9EJ86 889 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgef26D3YYY8 869 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abhd12bG3UZN6 359 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3264L7N2C5 238 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FaahO08914 579 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MafgO54790 162 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BpgmP15327 259 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RenbpP82343 430 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HmgcrQ01237 887 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3414Q3TNU4 584 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Proser1Q5PRE5 913 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abhd10Q6PE15 297 aa6.8□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.8 ms