RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kat2aQ9JHD2 830 aa13.09□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nupr1Q9WTK0 80 aa13.09□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa13.09□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh23Q99PF4 3354 aa13.09□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa13.08□□□□□ -0.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HdcP23738 662 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab20P35295 233 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kpnb1P70168 876 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf112Q0VAW7 879 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rap1gap2Q5SVL6 712 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CttnQ60598 546 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpysl3Q62188 570 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiaa1841Q68FF0 718 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ChpfQ6IQX7 774 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MregQ6NVG5 214 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1046Q7TR79 316 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpsf7Q8BTV2 471 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf276Q8CE64 614 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sbk1Q8QZX0 417 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zcchc14Q8VIG0 956 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gps1Q99LD4 471 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9CQC3 228 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam212aQ9CX62 282 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dusp21Q9D9D8 189 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ParvaQ9EPC1 372 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Caln1Q9JJG7 219 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmg1Q9JK23 289 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PodxlQ9R0M4 503 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt16Q9Z2K1 469 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tubb1A2AQ07 451 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc170D3YXL0 722 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tekt5G5E8A8 557 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pms2P54279 859 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc17a7Q3TXX4 560 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfhr2Q4LDF6 332 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Soat1Q61263 540 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mpp4Q6P7F1 635 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AmphQ7TQF7 686 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CyldQ80TQ2 952 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Haus3Q8QZX2 570 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Toe1Q9D2E2 511 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plod1Q9R0E2 728 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cetn2Q9R1K9 172 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpv2Q9WTR1 756 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crlf3Q9Z2L7 442 aa13.08□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cntnap4Q99P47 1310 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mroh4G3X8W1 983 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anxa8O35640 327 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r1O70410 912 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stmn1P54227 149 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rasgrf2P70392 1189 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VcpQ01853 806 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbp8Q2V6D6 525 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mylk3Q3UIZ8 795 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smcr8Q3UMB5 935 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grik1Q60934 836 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Papss1Q60967 624 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad9bQ6WBX7 403 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lig4Q8BTF7 911 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr27Q8C5V5 780 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrif1Q8CDD9 755 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sugp1Q8CH02 643 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UvragQ8K245 698 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epn3Q91W69 636 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpa3Q9CQ71 121 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem86aQ9D8N3 241 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trhr2Q9ERT2 382 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr731F8VQB9 326 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rtn2O70622 471 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcpt4P21812 246 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdcd2P46718 343 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr2c2P49117 596 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrn4clQ3TYX2 239 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mansc4Q3UU94 337 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc9b2Q5BKR2 547 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pik3r5Q5SW28 871 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chmp2bQ8BJF9 213 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pak4Q8BTW9 593 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OafQ8QZR4 282 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo33Q8VE08 562 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd54Q91WK7 299 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MrgpreQ91ZB7 310 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcrs1Q99L90 462 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nsmce3Q9CPR8 279 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mphosph6Q9D1Q1 161 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D4A5 307 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tomm20lQ9D4V6 152 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa13.07□□□□□ -0.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6v1c1Q9Z1G3 382 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.2 ms